This HTML5 document contains 47 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/typAkce/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n21http://purl.org/net/nknouf/ns/bibtex#
n8http://localhost/temp/predkladatel/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216224%3A14110%2F05%3A00013202%21RIV10-MZ0-14110___/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n12http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216224%3A14110%2F05%3A00013202%21RIV10-MZ0-14110___
rdf:type
n7:Vysledek skos:Concept
dcterms:description
V této práci jsme se soustředili na kompletní restrikční mapování genomů pěti příbuzných treponemálních kmenů zahrnující T. pallidum subsp. pallidum Nichols, T. pallidum subsp. pallidum SS14, T. pallidum subsp. pertenue Samoan D, T. pallidum subsp. pertenue Gauthier a T. paraluiscuniculi. Genom T. pallidum subsp. pallidum Nichols byl rozdělen do 87 překrývajících se oblastí (TPI intervaly). Každý z těchto intervalů byl amplifikován u všech studovaných kmenů pomocí XL PCR a PCR produkty byly štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I, Hind III nebo jejich kombinacemi. Takto získaný restrikční profil byl použit k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikované nukleotidové záměny lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů. V této práci jsme se soustředili na kompletní restrikční mapování genomů pěti příbuzných treponemálních kmenů zahrnující T. pallidum subsp. pallidum Nichols, T. pallidum subsp. pallidum SS14, T. pallidum subsp. pertenue Samoan D, T. pallidum subsp. pertenue Gauthier a T. paraluiscuniculi. Genom T. pallidum subsp. pallidum Nichols byl rozdělen do 87 překrývajících se oblastí (TPI intervaly). Každý z těchto intervalů byl amplifikován u všech studovaných kmenů pomocí XL PCR a PCR produkty byly štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I, Hind III nebo jejich kombinacemi. Takto získaný restrikční profil byl použit k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikované nukleotidové záměny lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů. Restriction mapping was used for comparison of four treponemal genomes including strains T. pallidum subsp. pallidum Nichols, T. pallidum subsp. pallidum SS14, T. pallidum subsp. pertenue Samoan D and T. paraluiscuniculi. The genomes of analysed strains were divided into 94 intervals (TPI intervals) covering the whole genome and each of these segments was amplified by XL PCR. These PCR products were digested by restriction enzymes BamH I, EcoR I and Hind III and the resulting restiction profiles were used for identification of heterologous regions in chromosomal DNA. The results indicate a high sequence homology among treponemal strains. Different degrees of virulence of treponemal strains thus appear to depend on relatively small differences in their genomes. The genome differences are preferentially localized in tpr genes. Identified nucleotide changes can be used for molecular identification of individual treponemal strains or isolates.
dcterms:title
restriction mapping of the treponemal genomes Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.
skos:prefLabel
Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. restriction mapping of the treponemal genomes
skos:notation
RIV/00216224:14110/05:00013202!RIV10-MZ0-14110___
n3:aktivita
n5:Z n5:P
n3:aktivity
P(GA310/04/0021), P(NI7351), Z(MSM0021622415)
n3:dodaniDat
n12:2010
n3:domaciTvurceVysledku
n11:4942558 n11:8932395
n3:druhVysledku
n16:D
n3:duvernostUdaju
n4:S
n3:entitaPredkladatele
n14:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
540973
n3:idVysledku
RIV/00216224:14110/05:00013202
n3:jazykVysledku
n19:cze
n3:klicovaSlova
Treponema pallidum ssp. pallidum; Treponema pallidum ssp. pertenue; Treponema paraluiscuniculi
n3:klicoveSlovo
n13:Treponema%20paraluiscuniculi n13:Treponema%20pallidum%20ssp.%20pallidum n13:Treponema%20pallidum%20ssp.%20pertenue
n3:kontrolniKodProRIV
[F337D7B0A063]
n3:mistoKonaniAkce
Devět skal – Žďárské vrchy
n3:mistoVydani
ČR
n3:nazevZdroje
Chemické listy
n3:obor
n20:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n3:pocetTvurcuVysledku
2
n3:projekt
n6:NI7351 n6:GA310%2F04%2F0021
n3:rokUplatneniVysledku
n12:2005
n3:tvurceVysledku
Strouhal, Michal Šmajs, David
n3:typAkce
n17:CST
n3:zahajeniAkce
2005-06-15+02:00
n3:zamer
n10:MSM0021622415
s:issn
0009-2770
s:numberOfPages
2
n21:hasPublisher
ČCHS
n8:organizacniJednotka
14110