This HTML5 document contains 45 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/typAkce/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n14http://localhost/temp/predkladatel/
n9http://purl.org/net/nknouf/ns/bibtex#
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216224%3A14110%2F03%3A00012309%21RIV%2F2005%2FMZ0%2F141105%2FN/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n19http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216224%3A14110%2F03%3A00012309%21RIV%2F2005%2FMZ0%2F141105%2FN
rdf:type
n7:Vysledek skos:Concept
dcterms:description
DNA microarray technology was utilized to study gene expression by the syphilis spirochete Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols) isolated from rabbit testes 10 days post infection. Microarrays containing all 1039 annotated ORFs of Treponema pallidum subspecies pallidum (Nichols) were printed on glass slides. For 1034 ORFs (out of 1039), signals higher than the threshold (average of negative control spots + 3 SDs) were detected for both RNA and DNA probes. The most highly transcribed genes were found to correlate with the most conspicuous spots identified by two dimensional gel electrophoresis, indicating that the transcript levels generally corresponded to the relative protein concentrations. Genes with high transcript concentrations included those encoding flagellar filament and cytoplasmic filament proteins, prominent lipoproteins and membrane proteins, chaperonins, proteins involved in red-ox balance, chemotaxis regulatory proteins, a V-ATPase operon, and certain metabolic enzymes such as gl Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou u 84 genů vykaz Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou u 84 genů vykaz
dcterms:title
Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků Transkriptome of Treponema pallidum: gene expression levels during experimental rabbit infection
skos:prefLabel
Transkriptome of Treponema pallidum: gene expression levels during experimental rabbit infection Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků
skos:notation
RIV/00216224:14110/03:00012309!RIV/2005/MZ0/141105/N
n3:strany
14 - 15
n3:aktivita
n6:P
n3:aktivity
P(NI7351)
n3:dodaniDat
n19:2005
n3:domaciTvurceVysledku
n5:9995307 n5:4942558
n3:druhVysledku
n12:D
n3:duvernostUdaju
n18:S
n3:entitaPredkladatele
n20:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
631364
n3:idVysledku
RIV/00216224:14110/03:00012309
n3:jazykVysledku
n16:cze
n3:klicovaSlova
transcriptome, treponema pallidum
n3:klicoveSlovo
n13:treponema%20pallidum n13:transcriptome
n3:kontrolniKodProRIV
[B259D801CAD3]
n3:mistoKonaniAkce
Brno, Komenského nám. 2
n3:mistoVydani
Brno
n3:nazevZdroje
Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003
n3:obor
n10:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n3:pocetTvurcuVysledku
4
n3:projekt
n15:NI7351
n3:rokUplatneniVysledku
n19:2003
n3:tvurceVysledku
Šmajs, David Norris, S. J. Weinstock, G. M. Matějková, Petra
n3:typAkce
n8:CST
n3:zahajeniAkce
2003-06-04+02:00
s:numberOfPages
1
n9:hasPublisher
Masarykova univerzita. Lékařská fakulta
n14:organizacniJednotka
14110