This HTML5 document contains 45 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n15http://localhost/temp/predkladatel/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216208%3A11150%2F07%3A00004060%21RIV08-MSM-11150___/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n13http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216208%3A11150%2F07%3A00004060%21RIV08-MSM-11150___
rdf:type
skos:Concept n14:Vysledek
dcterms:description
The MALDI-TOF MS is an ideal method for routine identification of proteins separated by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2D-P AGE). However, in some cases the outputs from peptide mass fingerprinting (PMF) do not enable unambiguous identification of proteins. In such situation, determination of a partial amino acid sequence of the target protein would be extremely helpful in the PMF identification. Sequencing using MALDI-TOF post-source decay (PSD) usually generates complex spectra and the fragmentation is not complete. PSD sequencing with chemically assisted fragmentation allows to avoid these problems. Application of both methods in identification of proteins of Francisella tularensis is presented. MALDI-TOF MS je ideální metodou pro rutinní identifikaci bílkovin separovaných dvojrozměrnou elektroforézou na polyakrylamidovém gelu (2D-PAGE). Nicméně v některých případech výsledky z fingerprintingu peptidové hmoty (PMF) neumožní jednoznačnou identifikaci bílkovin. V takových situacích by bylo určení částečné aminokyselinové sekvence cílové bílkoviny u PMF identifikací velmi prospěšné. Sekvenace za pomoci MALDI-TOF post-source decay (PSD) obvykle vytváří komplexní spektra a fragmentace není dokončena. PSD sekvenace spolu s chemicky podporovanou fragmentací umožňuje se vyhnout těmto problémům. V následující části tohoto sdělení je prezentována aplikace obou metod při identifikaci bílkovin z Francisely tularensis. The MALDI-TOF MS is an ideal method for routine identification of proteins separated by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2D-P AGE). However, in some cases the outputs from peptide mass fingerprinting (PMF) do not enable unambiguous identification of proteins. In such situation, determination of a partial amino acid sequence of the target protein would be extremely helpful in the PMF identification. Sequencing using MALDI-TOF post-source decay (PSD) usually generates complex spectra and the fragmentation is not complete. PSD sequencing with chemically assisted fragmentation allows to avoid these problems. Application of both methods in identification of proteins of Francisella tularensis is presented.
dcterms:title
Identification of Proteins by Combination of Peptide Mass Fingerprinting and Fragmentation of Sulfonated Peptides Identifikace proteinů pomocí kombinace proteinové hmotností spektrometrie a fragmentace sulfonovaných proteinů Identification of Proteins by Combination of Peptide Mass Fingerprinting and Fragmentation of Sulfonated Peptides
skos:prefLabel
Identification of Proteins by Combination of Peptide Mass Fingerprinting and Fragmentation of Sulfonated Peptides Identifikace proteinů pomocí kombinace proteinové hmotností spektrometrie a fragmentace sulfonovaných proteinů Identification of Proteins by Combination of Peptide Mass Fingerprinting and Fragmentation of Sulfonated Peptides
skos:notation
RIV/00216208:11150/07:00004060!RIV08-MSM-11150___
n3:strany
264;267
n3:aktivita
n10:S
n3:aktivity
S
n3:cisloPeriodika
5
n3:dodaniDat
n13:2008
n3:domaciTvurceVysledku
n12:5863163
n3:druhVysledku
n7:J
n3:duvernostUdaju
n11:S
n3:entitaPredkladatele
n17:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
425310
n3:idVysledku
RIV/00216208:11150/07:00004060
n3:jazykVysledku
n4:eng
n3:klicovaSlova
Identification; Proteins; Combination; Peptide; Fingerprinting; Fragmentation; Sulfonated; Peptides
n3:klicoveSlovo
n6:Fingerprinting n6:Peptide n6:Sulfonated n6:Combination n6:Proteins n6:Fragmentation n6:Identification n6:Peptides
n3:kodStatuVydavatele
CZ - Česká republika
n3:kontrolniKodProRIV
[42985FF0EB38]
n3:nazevZdroje
Chemické listy
n3:obor
n16:CE
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
1
n3:pocetTvurcuVysledku
2
n3:rokUplatneniVysledku
n13:2007
n3:svazekPeriodika
98
n3:tvurceVysledku
Stulík, Jiří
s:issn
0009-2770
s:numberOfPages
4
n15:organizacniJednotka
11150