This HTML5 document contains 48 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/typAkce/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n4http://purl.org/net/nknouf/ns/bibtex#
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n21https://schema.org/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00027006%3A_____%2F12%3A00002215%21RIV13-MZE-00027006/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n17http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00027006%3A_____%2F12%3A00002215%21RIV13-MZE-00027006
rdf:type
skos:Concept n14:Vysledek
dcterms:description
Pro detekci virů česneku Onion yellow dwarf virus (OYDV), Leek yellow stripe virus (LYSV), Garlic common latent virus (GCLV), Shallot latent virus (SLV) a Mite-borne filamentous virus (MbFV) byly navrženy primery na základě sekvencí genu pro plášťový protein a byla optimalizována metoda SYBR Green real-time RT PCR. Touto metodou byl provedeno stanovení obsahu pěti uvedených druhů virů u 50 genotypů česneku (Allium sativum L.) pocházejícího z různých zemí světa a u 24 genotypů česneku po odvirování. Účinnosti reakcí byly 97 % (OYDV), 93 % (LYSV), 99 % (SVL), 98 % (GCLV) a 87 % (MbFV). Detekční limit pro OYDV, LYSV a GCLV je 5 kopií, u SLV 15 kopií a u MbFV 130 kopií genu pro plášťový protein. Ve srovnání s ELISA byla přítomnost virů prokázána u většího procenta studovaných genotypů. Nejvíce byly vzorky napadeny virem OYDV a GCLV. Pro detekci virů česneku Onion yellow dwarf virus (OYDV), Leek yellow stripe virus (LYSV), Garlic common latent virus (GCLV), Shallot latent virus (SLV) a Mite-borne filamentous virus (MbFV) byly navrženy primery na základě sekvencí genu pro plášťový protein a byla optimalizována metoda SYBR Green real-time RT PCR. Touto metodou byl provedeno stanovení obsahu pěti uvedených druhů virů u 50 genotypů česneku (Allium sativum L.) pocházejícího z různých zemí světa a u 24 genotypů česneku po odvirování. Účinnosti reakcí byly 97 % (OYDV), 93 % (LYSV), 99 % (SVL), 98 % (GCLV) a 87 % (MbFV). Detekční limit pro OYDV, LYSV a GCLV je 5 kopií, u SLV 15 kopií a u MbFV 130 kopií genu pro plášťový protein. Ve srovnání s ELISA byla přítomnost virů prokázána u většího procenta studovaných genotypů. Nejvíce byly vzorky napadeny virem OYDV a GCLV. SYBR Green real-time RT PCR assay was developed and optimised for the detection of Onion yellow dwarf virus (OYDV), Leek yellow stripe virus (LYSV), Garlic common latent virus (GCLV), Shallot latent virus (SLV) and Mite-borne filamentous virus (MbFV). The assay was tested on 50 genotypes of garlic (Allium sativum L.) which originated from different countries and on 24 garlic genotypes after a process of viruses remove. The efficiencies of all reactions were 97 %, 93 %, 99 %, 98 % and 87 % for OYDV, LYSV, SLV, GCLV and MbFV standards respectively. The detection limit for OYDV, LYSV and GCLV was as low as 5 gene copies, for SLV it was 15 gene copies and for MbFV was 130 gene copies. In comparison to ELISA, more virus positive garlic accessions were found for LYSV and GCLV by SYBR Green-based real-time RT PCR assay. OYDV and GCLV were found the most prevalent viruses in analysed samples.
dcterms:title
Detection of garlic viruses using SYBR Green Real-Time RT PCR Detekce virů česneku pomocí SYBR Green Real-Time RT PCR Detekce virů česneku pomocí SYBR Green Real-Time RT PCR
skos:prefLabel
Detekce virů česneku pomocí SYBR Green Real-Time RT PCR Detection of garlic viruses using SYBR Green Real-Time RT PCR Detekce virů česneku pomocí SYBR Green Real-Time RT PCR
skos:notation
RIV/00027006:_____/12:00002215!RIV13-MZE-00027006
n14:predkladatel
n15:ico%3A00027006
n3:aktivita
n16:P n16:Z
n3:aktivity
P(QH71228), Z(MZE0002700604)
n3:dodaniDat
n17:2013
n3:domaciTvurceVysledku
n8:4768523 n8:3785440
n3:druhVysledku
n9:D
n3:duvernostUdaju
n20:S
n3:entitaPredkladatele
n19:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
130508
n3:idVysledku
RIV/00027006:_____/12:00002215
n3:jazykVysledku
n22:cze
n3:klicovaSlova
OYDV; LYSV; GCLV; SLV; MbFV
n3:klicoveSlovo
n5:MbFV n5:OYDV n5:LYSV n5:GCLV n5:SLV
n3:kontrolniKodProRIV
[7BA38E5A3253]
n3:mistoKonaniAkce
Regionální centrum Olomouc
n3:mistoVydani
Praha
n3:nazevZdroje
Česnek ve 21. století
n3:obor
n13:GF
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n3:pocetTvurcuVysledku
2
n3:projekt
n11:QH71228
n3:rokUplatneniVysledku
n17:2012
n3:tvurceVysledku
Leišová-Svobodová, Leona Smékalová, Kateřina
n3:typAkce
n10:CST
n3:zahajeniAkce
2012-01-01+01:00
n3:zamer
n18:MZE0002700604
s:numberOfPages
8
n4:hasPublisher
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
n21:isbn
978-80-7427-102-1