This HTML5 document contains 39 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LD14004/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n14http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:LD14004
rdf:type
n13:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=LD14004 http://www.umbr.cas.cz
dcterms:description
Using parallel sequencing (next generation sequencing), RNA virome of sweet and sour cherry will be analysed. At the same time, phytoplasmas infections resembling symptoms of virus infection will be detected by PCR. Newly found viruses will be molecularly characterized and classified, and con-served or variable parts of genomes will be reported. Genetic variability of identified phytoplasmas will be analysed. For all pathogens discovered, specific primers will be developed allowing detection of these from total RNA. The cases of virus and phytoplasma mixed infections will be recorded. Pomocí paralelního sekvenování (next generation sequencing) bude analyzován RNA virom třešní a višní. Zároveň bude pomocí PCR zjištěn výskyt fytoplazem, které mohou vyvolávat příznaky podobné virovým infekcím. Nově nalezené viry či jejich kmeny budou molekulárně popsány a zařazeny, na jejich genomu budou vyhledávány konzervované a variabilní úseky. U identifikovaných fytoplazem bude charakterizována genetická variabilita. Na základě výsledků budou pro účely rutinní detekce vyvinuty specifické primery detekující všechny zjištěné patogeny z celkové RNA. Budou popsány případné směsné infekce virů a fytoplazem.
dcterms:title
Cherry virome deep sequencing analysis and development of virus specific PCR detection tools. Analýza viromu třešní a višní sekvenováním nové generace a vývoj nástrojů pro specifickou detekci virů PCR.
skos:notation
LD14004
n3:aktivita
n20:LD
n3:celkovaStatniPodpora
n17:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n17:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-04-29+02:00
n3:druhSouteze
n8:VS
n3:duvernostUdaju
n16:S
n3:fazeProjektu
n15:101028326
n3:hlavniObor
n7:EE
n3:kategorie
n21:ZV
n3:klicovaSlova
next generation sequencing; virus; phytoplasma; cherry; sour cherry
n3:partnetrHlavni
n5:ico%3A60077344
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
0
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
0
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-05-19+02:00
n3:prideleniPodpory
n19:MSMT-8634%2F2014-1
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n14:2015
n3:sberDatUdajeProjZameru
n14:2015
n3:soutez
n12:SMSM2014LD4
n3:statusZobrazovaneFaze
n11:DRRVB
n3:typPojektu
n4:P
n3:ukonceniReseni
2016-04-30+02:00
n3:vedlejsiObor
n7:EB
n3:zahajeniReseni
2014-04-01+02:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n9:ZB
n3:klicoveSlovo
phytoplasma virus next generation sequencing cherry