This HTML5 document contains 40 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB4050312/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n17http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:KJB4050312
rdf:type
n21:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB4050312
dcterms:description
The topic of this project is a study of interactions in HIV-1 protease-inhibitor complexes. The project follows up the previous grant of the AS CR A4050811 (1998-2001) aimed on the experimental determination of structure of HIV-1 protease complexes. Experimental material gained during this project represent significant part of the up to date knowledge about these systems and deserves more careful inspection from the point of view energetics. Several HIV protease complexes sill be solved in the frame of this new project, that will be used for elucidation of role of weak hydrogen bonds observed in these systems. The interaction energy between protease and inhibitor will be analysed in details using molecular modelling. Detailed analysis of accuracy of the used methods will be done. Especially, thequality of description of weak hydrogen bonds by empirical potential based molecular modelling will be analysed. Náplní projektu je studium interakcí v komplexech HIV-1 proteázy s inhibitory. Projekt svou tématikou navazuje na již dříve dosažené výsledky, kdy na našem pracovišti bylo v rámci grantu AV ČR A4050811 (1998-2001) pomocí rentgenové strukturní analýzy vyřešeno několik struktur inhibovaných HIV proteáz. Experimentální materiál o struktuře získaný během tohoto projektu představuje významnou část současných znalostí o struktuře těchto systémů a zaslouží proto hlubší analýzu z hlediska energetiky pozorovaných intermolekulárních interakcí. V rámci tohoto projektu budou vyřešeny další struktury HIV-1 proteázy s inhibitory, které budou použity pro objasnění role slabých vodíkových vazeb pozorovaných v těchto systémech. Interakční energie mezi proteázou a inhibitory bude detailně analyzována pomocí molekulárního modelování. Práci bude předcházet důkladný rozbor přesnosti užitých metod, zejména popisu slabých vodíkových vazeb pomocí molekulárního modelování.
dcterms:title
Studium interakcí v komplexech HIV-1 proteázy s inhibitory Study of Interactions in Complexes of HIV-1 protease with Inhibitors
skos:notation
KJB4050312
n3:aktivita
n18:KJ
n3:celkovaStatniPodpora
n4:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n4:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-02-12+01:00
n3:druhSouteze
n8:VS
n3:duvernostUdaju
n10:S
n3:fazeProjektu
n20:33614427
n3:hlavniObor
n13:CF
n3:hodnoceniProjektu
n16:U
n3:kategorie
n15:ZV
n3:klicovaSlova
HIV-1 protease; inhibitor; molecular modeling; X-ray diffraction; structure analysis; protein-ligand interaction
n3:partnetrHlavni
n11:ico%3A61389013
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
6
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
6
n3:rokUkonceniPodpory
n17:2005
n3:rokZahajeniPodpory
n17:2003
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n17:2006
n3:sberDatUdajeProjZameru
n17:2006
n3:soutez
n12:SAV02003-XJ
n3:statusZobrazovaneFaze
n9:DUU
n3:typPojektu
n5:P
n3:vedlejsiObor
n13:CF
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Using X-ray diffraction analysis, several structures of HIV-1 protease in complexes with its inhibitors were solved. Using molecular modelling, importance of conformational changes and binding energies was assessed. Pomocí rentgenové difrakce bylo vyřešeno několik struktur HIV-1 proteázy v komplexech s jejími inhibitory. Pomocí molekulárního modelování byl posouzen význam konformačních změn a vazebných energií při interakci proteáza - inhibitor.
n3:zivotniCyklusProjektu
n14:ZBKU
n3:klicoveSlovo
inhibitor HIV-1 protease X-ray diffraction molecular modeling structure analysis