This HTML5 document contains 43 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB400500602/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n18http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:KJB400500602
rdf:type
n13:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB400500602
dcterms:description
Unnatural nucleobases incorporated into DNA molecules are the basis of the expanded genetic alphabet, which opens the way to a variety of biotechnology applications. Using the methods of theoretical chemistry, we will study the role various structural and environmental effects play in the stabilization of oligonucleotide duplexes containing unnatural nucleobases and in the selectivity of the respective pairing schemes. We will elaborate and apply highly reliable computational protocols for the description of both the intrinsic and external influences leading to the formation of stable and selective unnatural nucleobase-containing motifs. The intrinsic and external factors will be characterized by ab initio quantum chemical methods and classical molecular dynamics, respectively. Based on computational data, the theory of significant prediction value will be developed which combines these contributions and thus enables to quantify the stability and selectivity of novel DNA skeletons. Nepřirozené báze zabudované do molekul DNA tvoří základ rozšířené genetické abecedy, jež otvírá cestu k mnohým biotechnologickým aplikacím. Pomocí metod teoretické chemie prostudujeme roli různých strukturních a vnějších efektů rozhodujících pro stabilizaci dvoušroubovic DNA obsahujících nepřirozené báze a pro selektivitu vazebných schémat, jež se v nich vyskytují. Vypracujeme vysoce spolehlivé výpočetní postupy pro popis jak vnitřních, tak vnějších vlivů vedoucích k tvorbě stabilních a selektivních strukturních motivů obsahujících nepřirozené báze; tyto postupy upotřebíme během rozsáhlých výpočtů. Vnitřní vlivy budou studovány ab initio kvantově chemickými metodami, kdežto vliv okolí bude popsán pomocí klasické molekulové dynamiky s explicitním zahrnutím molekul rozpouštědla a protiiontů. Na základě vypočtených dat bude vyvinuta teorie s významnou predikční schopností, jež společně popisuje tyto vlivy a tím umožňuje kvantifikovat stabilitu a selektivitu neobvyklých fragmentů v DNA.
dcterms:title
Teorie stability a selektivity nepřirozených bází DNA The Theory of Stability and Selectivity of Unnatural DNA Nucleobases
skos:notation
KJB400500602
n3:aktivita
n4:KJ
n3:celkovaStatniPodpora
n17:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n17:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2013-11-05+01:00
n3:druhSouteze
n21:VS
n3:duvernostUdaju
n22:S
n3:fazeProjektu
n7:69284272
n3:hlavniObor
n8:CD
n3:hodnoceniProjektu
n11:O
n3:kategorie
n10:ZV
n3:klicovaSlova
DNA; unnatural nucleobases; stability; selectivity; nonbonding interactions; ab initio quantum chemical methods; molecular dynamics; hydrophobic effect
n3:partnetrHlavni
n14:ico%3A61389013
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
4
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
4
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2008-02-21+01:00
n3:prideleniPodpory
n12:KJB400500602
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n18:2008
n3:sberDatUdajeProjZameru
n18:2009
n3:soutez
n19:SAV02006-B
n3:statusZobrazovaneFaze
n20:DUU
n3:typPojektu
n16:P
n3:ukonceniReseni
2008-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2006-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Přestože se povedlo dosáhnout dílčích úspěchů projektu, nebyly výsledky dosud adekvátním způsobem publikovány. While some partial succes of the project has been reached, the results of the project have not been published adequately.
n3:zivotniCyklusProjektu
n9:ZBKU
n3:klicoveSlovo
DNA stability selectivity nonbonding interactions ab initio quantum chemical methods molecular dynamics unnatural nucleobases