This HTML5 document contains 38 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA5052206/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n13http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:IAA5052206
rdf:type
n15:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA5052206
dcterms:description
The streptomycin (str) operon, one of the most conserved operons in prokaryotic evolution, is in E. coli composed of four house-keeping genes: rpsL, rpsG, and fus, tufA, coding for ribosomal proteins S12, S7, and elongation factors EF-G, EF-Tu, respectively. Our studies revealed that str operon of gram-positive B. stearothermophilus and B. subtilis carries at its 5' end an additional gene, designated ybxF. Its transcription affected expression of other four genes of the operon. ybxF codes in both organisms for a protein of unknown function. The gene is also present in some other gram-positive bacteria but gram-negative bacteria have no homologue of ybxF. A complex study of bacillar ybxF significance is proposed: 1) B. subtilis with removed (knocked-out) abyF gene will be generated and characterized, 2) consequences of ybxF protein overproduction for growth and transcription will be examined, 3) ybxF protein will be isolated, tested and crystallized to detemine its 3D structure. Streptomycinový (str) operon, jeden z nejvíce evolučně konservovaných operonů u prokaryotů, se u E. coli skládá ze čtyř %22house-keeping%22 genů: rpsL, rpsG, fus a tufA. První dva geny kodují ribosomální bílkoviny S12 a S7, druhé dva elongační faktory EF-G a EF-Tu. Nedávno jsme prokázali, že str operon gram-positivníchj bakterií B. stearothermophilus a b. subtilis, nese na svém 5'konci ještě další gen, nazvaný ybxF. Jeho transkripce ovlivňuje expresi zbylých čtyř genů operonu. ybxF koduje v obou organismech protein s dosud neznámou funkcí a podle údajů v databasích je tento gen přítgomen i v dalších gram-positivních bakteriích. Zcela ale chybí v bakteriích gram-negativních. V projektu se navrhuje provedení komplexní studie ybxF: 1) Bude připraven a charakterizován B. subtilis bez genu ybxF (ybxF knoc-out), 2) Budou určeny důsledky zvýšené produkce proteinu abxF pro transkripci a buňku, 3) Protein ybxF bude isolován, testován a krystalizován k určení 3D struktury.
dcterms:title
Gen ybxF, nově identifikovaný člen streptomycinového operonu u Bacillus subtilis Gene ybxF, a newly identified member of the streptomycin operon of Bacillus subtilis
skos:notation
IAA5052206
n3:aktivita
n14:IA
n3:celkovaStatniPodpora
n9:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n9:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2007-09-26+02:00
n3:druhSouteze
n18:VS
n3:duvernostUdaju
n5:S
n3:fazeProjektu
n8:33614893
n3:hlavniObor
n11:EB
n3:hodnoceniProjektu
n4:N
n3:kategorie
n6:ZV
n3:klicovaSlova
Bacillus subtilis; str operon; ybx F gene; ybx F protein function
n3:partnetrHlavni
n21:ico%3A68378050
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
3
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
3
n3:rokUkonceniPodpory
n13:2005
n3:rokZahajeniPodpory
n13:2002
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n13:2006
n3:sberDatUdajeProjZameru
n13:2006
n3:soutez
n20:SAV02002-AB
n3:statusZobrazovaneFaze
n10:DUU
n3:typPojektu
n17:P
n3:vedlejsiObor
n11:EE
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
The first gene of the streptomycin operon of Bacillus subtilis, called ybxF, is not an essential gene coding for a ribosomal protein of 82 amino acid residues. GreA protein inhibits activity of RNA polymerase initiating from rrn promoters in vitro. První gen streptomycinového operonu Bacillus subtilis, nazvaný ybxF, je neesenciálním genem kodujícím malou ribosomální bílkovinu o 82 aminokyselinách. Protein GreA inhibuje aktivitu RNA polymerázy B. subtilis při iniciaci z rrn promotorů in vitro.
n3:zivotniCyklusProjektu
n19:ZBBKU
n3:klicoveSlovo
str operon ybx F gene Bacillus subtilis