This HTML5 document contains 45 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA401630901/
n16http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:IAA401630901
rdf:type
n18:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA401630901
dcterms:description
The main objective of this project is to study evolution of substrate specificity in microbial enzymes acting on xenobiotic compounds. Selected model system, haloalkane dehalogenases, is suitable for this purpose since these enzymes act on recalcitrant compounds which have not been available in the biosphere until industrial revolution. Evolution will be studied recursively by quantitative characterization of the substrate specificity of modern haloalkane dehalogenases and their comparison with ancestral enzymes designed by phylogenetic inference and constructed by gene synthesis. The ultimate goal will be estimation of the level of functional overlap of individual protein subfamilies and dissecting molecular events leading to specialization of enzymes for efficient catalysis of their xenobiotic substrates. Various theoretical and experimental approaches will be employed to obtain appropriate biological material and collect data for testing of alternative evolutionary hypotheses. Hlavním cílem projektu je studium evoluce substrátové specifity mikrobiálních enzymů aktivních s xenobiotickými sloučeninami. Zvolený modelovým systém, halogenalkandehalogenasy, je vhodný k tomuto účelu vzhledem k aktivitě dehalogenas enzymů s biologicky špatně rozložitelnými sloučeninami, které se v biosféře nevyskytovaly před průmyslovou revolucí. Evoluce bude studována rekurzivně kvantitativním popisem substrátové specifity moderních halogenalkandehalogenas a srovnáním se specifitou předků těchto enzymů navržených fylogenetickou dedukcí a konstruovaných genovou syntézou. Konečným výsledkem této analýzy bude ohodnocení funkčního přesahu jednotlivých podrodin a podrobný popis molekulárních událostí vedoucích ke specializaci těchto enzumů umožňující účinný rozklad xenobiotických substrátů. Různé teoretické a experimentální přístupy budou použity k přípravě biologického materiálu a ke sběru dat nezbytných k testování alternativních evolučních hypotéz.
dcterms:title
Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami Evolution of substrate specificity in enzymes acting on xenobiotic compounds
skos:notation
IAA401630901
n3:aktivita
n14:IA
n3:celkovaStatniPodpora
n19:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n19:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-04-14+02:00
n3:druhSouteze
n20:VS
n3:duvernostUdaju
n4:S
n3:fazeProjektu
n21:100738400
n3:hlavniObor
n13:CE
n3:hodnoceniProjektu
n6:V
n3:kategorie
n7:ZV
n3:klicovaSlova
evolution; enzymes; dehalogenation; multivariate statistics; substrate specificity; molecular modelling; virtual screening; QSAR and 3D QSAR
n3:partnetrHlavni
n12:orjk%3A14310
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
66
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
66
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2013-02-27+01:00
n3:prideleniPodpory
n15:IAA401630901
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n16:2013
n3:sberDatUdajeProjZameru
n16:2014
n3:soutez
n17:SAV02009-A
n3:statusZobrazovaneFaze
n11:DUU
n3:typPojektu
n22:P
n3:ukonceniReseni
2013-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n13:EE n13:EB
n3:zahajeniReseni
2009-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Bylo charakterizováno šest moderních a pět předků halogenalkandehalogenas. Předci vykazovali významně zvýšenou termální stabilitu a dobrou katalytickou aktivitu. Byl zaveden nový systém kvantitativní klasifikace enzymů podle jejich specifity. Six modern and five ancestral haloalkane dehalogenases were characterized. The ancestors showed highly improved thermostability and good activity. A novel system for quantitative classification of enzymes based on their specificity was established.
n3:zivotniCyklusProjektu
n9:ZBBBKU
n3:klicoveSlovo
dehalogenation virtual screening substrate specificity evolution enzymes multivariate statistics molecular modelling