This HTML5 document contains 42 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n22http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400550808/
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n17http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:IAA400550808
rdf:type
n18:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA400550808
dcterms:description
Struktura biomolekul je závislá na celé řadě interakcí. Z nekovalentních interakcí kromě vodíkových vazeb a patrových sil má na stabilitu biopolymerů vliv okolní prostředí, v kterém se tyto molekuly nacházejí. Konformace a stabilita aminokyselin a složek nukleových kyselin v přítomnosti vody a iontů bude studována jak metodami molekulové dynamiky a mechaniky, tak predevším na ab initio úrovni metodami, které korektně popisují všechny složky interakční energie uvedených komplexů. Po podrobném prozkoumání povrchů potenciální a volné energie komplexů s použitím časově méně náročných metod budou pro nejstabilnější struktury spočteny přesné hodnoty interakčních energií na kvalitativně vyšší úrovni. Pro tyto struktury budou rovněž vypočtena IR spektra, která budou použita pro interpretaci experimentálních dat. Non-covalent interactions are very important for structure and dynamics of biomolecules (DNA, proteins). Between these interactions besides H-bonded and stacked interactions between the bases in nucleic acids and amino acids in proteins the environment - water molecules and ions - plays a very important role. The complexes amino acids, short peptides of nucleosides and nucleotides an their pairs with water and ions will be characterized by classical molecular dynamics, mechanics and mainly by the ab initio quantum chemical approaches. After detailed exploration of conformational landscapes of complexes using cheaper methods, the most stable structures will be studied at ab initio level. Geometries (inluding binding sites for water and ions) and exact values of interaction energies will be obtained and the calculated IR spectra will serve for an interpretation of experimental results.
dcterms:title
Hydration and solvation of building blocks of biopolymers Hydratace a solvatace stavebních jednotek biopolymerů
skos:notation
IAA400550808
n3:aktivita
n6:IA
n3:celkovaStatniPodpora
n14:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n14:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-02-12+01:00
n3:druhSouteze
n16:VS
n3:duvernostUdaju
n19:S
n3:fazeProjektu
n9:92913980
n3:hlavniObor
n4:CF
n3:hodnoceniProjektu
n7:V
n3:kategorie
n5:ZV
n3:klicovaSlova
nucleic acids; amino acids; hydration; solvation; ions; conformation; ab initio calculations
n3:partnetrHlavni
n20:ico%3A61388963
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
9
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
9
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2012-02-29+01:00
n3:prideleniPodpory
n13:IAA400550808
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n17:2012
n3:sberDatUdajeProjZameru
n17:2013
n3:soutez
n22:SAV02008-A
n3:statusZobrazovaneFaze
n21:DUU
n3:typPojektu
n12:P
n3:ukonceniReseni
2012-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2008-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Aims of the project were accomplished. Influence of solvent on tautomeric equilibrium of base pairs was clarified, method for assignment of vibration frequencies was developed and interactions of DNA chips with surface and fluorescent dyes were modeled. Cíle projektu se podařilo naplnit. Byl objasněn vlivu solventu na tautomerní rovnováhu párů bází, vyvinuta metoda pro neempirické přiřazování charakteristických vibracních frekvencí a byly modelovány interakce DNA čipů s nabitým povrchem a fluorofory.
n3:zivotniCyklusProjektu
n15:ZBBBKU
n3:klicoveSlovo
hydration ions solvation nucleic acids conformation amino acids