This HTML5 document contains 36 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

Prefix	IRI
n14	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n22	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n6	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n16	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dcterms	http://purl.org/dc/terms/
n2	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n17	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n15	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n12	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n9	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n13	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
n10	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP206%2F12%2FP338/
skos	http://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfs	http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n7	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n4	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n21	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n18	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdf	http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdh	http://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n19	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n8	http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item

n2:GPP206%2F12%2FP338

rdf:type

n9:Projekt

rdfs:seeAlso

http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP206/12/P338

dcterms:description

Phosphorylation is one of the most important post-translational modifications, which affects protein structure, function, and localization, regulating majority of biochemical processes. In our previous work we were engaged with molecular mechanisms of response of leukaemic cells MOLT-4 (p53-positive) and HL-60 (p53-negative)to ionising radiation. Submitted project proposes to characterize phosphoproteome of the mentioned cells, i.e. to identify phosphoproteins which are involved in radiation-induced signaling using tandem mass spectrometry, and to propose the potential biodosimetric markers. To date, no study has been published in the presented area mainly due to a very low abundance of phosphoproteins in the cell and due to insufficient ionization during MS analysis (acidic and hydrophilic character) compared to non-modified proteins. Therefore we will employ the newest methods for selective enrichment of phosphopeptides (bioaffinity chromatography) and recent knowledge to increase enrichment efficiency (methylation, pH adjustment etc.). Fosforylace je jednou z nejdůležitějších posttranslačních modifikací, která ovlivňuje funkci, strukturu a lokalizaci proteinu a pomocí níž je regulována většina biochemických procesů. V naší předchozí práci jsme se zabývali molekulárními mechanismy odpovědi leukemických buněk MOLT-4 (p53-positivní) a HL-60 (p53-negativní) na ozáření. Předkládaný projekt si klade za cíl charakterizovat fosfoproteom těchto buněk, tj. identifikovat fosfoproteiny, které jsou součástí signálních drah spouštěných po expozici ionizujícímu záření, dále určit přesná místa fosforylace pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie a navrhnout potenciální biodosimetrické markery. Doposud v tomto směru nebyla publikována žádná práce a to zejména proto, že absolutní množství fosfoproteinů v buňce je velmi malé a vzhledem ke kyselému a hydrofilnímu charakteru je účinnost jejich ionizace při MS analýzách podstatně nižší než u nemodifikovaných peptidů. Proto hodláme zapojit nejnovější metody pro selektivní obohacení fosfopeptidů (bioafinitní chromatografie) a využít nových poznatků vedoucích k optimalizaci dané metodiky.

dcterms:title

Analýza fosfoproteomu leukemických buněčných linií po ozáření. Phosphoproteomic analysis of leukaemic cells after irradiation.

skos:notation

GPP206/12/P338

n3:aktivita

n19:GP

n3:celkovaStatniPodpora

n10:celkovaStatniPodpora

n3:celkoveNaklady

n10:celkoveNaklady

n3:datumDodatniDoRIV

2015-05-22+02:00

n3:druhSouteze

n14:VS

n3:duvernostUdaju

n13:S

n3:fazeProjektu

n7:101097902

n3:hlavniObor

n4:CB

n3:hodnoceniProjektu

n16:U

n3:kategorie

n12:ZV

n3:klicovaSlova

phosphoproteins mass spectrometry leukaemia ionising radiation

n3:partnetrHlavni

n17:orjk%3AG44

n3:pocetKoordinujicichPrijemcu

0

n3:pocetPrijemcu

1

n3:pocetSpoluPrijemcu

0

n3:pocetVysledkuRIV

3

n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV

3

n3:posledniUvolneniVMinulemRoce

2014-02-28+01:00

n3:prideleniPodpory

n15:P206-12-P338

n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku

n8:2014

n3:sberDatUdajeProjZameru

n8:2015

n3:soutez

n21:SGA02011GA1PD

n3:statusZobrazovaneFaze

n18:DUU

n3:typPojektu

n6:P

n3:ukonceniReseni

2014-12-31+01:00

n3:zahajeniReseni

2012-01-01+01:00

n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem

The project results were published in two original articles and one review in impacted journals and two posters in international conferences. The goals declared in the projects were fulfilled; modifications of the work lead to additional results with respect to the original goals. A collaborator will use some of the results for a joint project with a leading Swiss proteomic laboratory. Výsledky projektu byly publikovány ve dvou originálních pracích a jedné rešerši v impaktovaných časopisech a jako dva postery na zahraničních konferencích. Cíle deklarované v projektu byly splněny; úpravy řešení vedly k získání výsledků nad rámec původních cílů. Na některé z výsledků naváže spolupracovnice v rámci společného projektu s přední švýcarskou proteomickou laboratoří.

n3:zivotniCyklusProjektu

n22:ZBKU