This HTML5 document contains 49 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GCP501%2F10%2FJ018/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n16http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GCP501%2F10%2FJ018
rdf:type
n12:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GCP501/10/J018
dcterms:description
V projektu budeme analyzovat mechanismy patogeneze dvou viroidů (malých infekčních, jednořetězcových, cirkulárních, nekódujících a autonomě se replikukjících molekul RNA) z čeledi Pospiviroidae: viroidu vřetenovitosti hlíz bramboru (PSTVd)-choroby řady plodin, druhů zeleniny i okrasných rostlin a expanzivního viroidu zakrslosti chmele (HSVd), nebezpečného zejména  pro pěstování chmele v Evropě. Na základě našeho předešlého studia chceme dále ověřit hypotézu, že viroidní patogeneze zahrnuje tvorbu malých viroid-specifických (vs) RNA, jejichž interakce vedou k poruchám regulace tzv. mikro RNA a transkripčních regulačních faktorů (TF) hostitele. Pro analýzu těchto mechanismů provedeme 1. tzv. „hluboké“ sekvenvání malých molekul RNA; 2. predickci cílových molekul pro vsRNA in silico zejména díky srovnání s výsledky dostupného celogenomového sekvenování genotypu rajčete citlivého k PSTVd; 3. ověření  molekulárních cílů vsRNA kvantitativními metodami anlýzy exprese RNA, TF, promotorové aktivity a technologií viry indukované suprese genů (VIGS) u druhu N. benthamiana, rajčete a chmelu.       We will analyze mechanisms of pathogenesis of two viroids (small, infectious, single-stranded, circular, non-coding and autonomously replicating RNAs) from Pospiviroidae family: potato spindle tuber viroid (PSTVd) infecting various crops, vegetables and ornamentals and highly expansive hop stunt viroid (HSVd) that, in particular, represents a danger to hops in Europe. Based on our previous study, we aim to verify the hypothesis that pathogenesis caused by pospiviroids involve viroid-specific (vs) small RNAs, mis-regulation of host-encoded microRNAs and plant transcription factors (TFs). To analyze the mechanism(s) of viroid pathogenesis we perform: 1. “deep” sequencing of small RNAs; 2. prediction of vsRNA targets in silico including the whole genome data of  PSTVd-sensitive tomato recently available; 3. verification of vsRNA molecular targets, components of silencing mechanisms and TFs involved in pospiviroid pathogenesis by quantitative RNA expression assays, promoter activity assays and by virus-induced gene silencing technology (VIGS) using N. benthamiana, tomato and hop.
dcterms:title
Pospiviroidní patogeneze jako regulační porucha zprostředkovaná malými viroid-specifickými RNA. Pospiviroid pathogenesis as “regulatory disorder“ mediated by viroid-specific small RNAs.
skos:notation
GCP501/10/J018
n4:aktivita
n17:GC
n4:celkovaStatniPodpora
n13:celkovaStatniPodpora
n4:celkoveNaklady
n13:celkoveNaklady
n4:datumDodatniDoRIV
2014-01-27+01:00
n4:druhSouteze
n8:VS
n4:duvernostUdaju
n7:S
n4:fazeProjektu
n9:92965750
n4:hlavniObor
n6:EB
n4:hodnoceniProjektu
n21:U
n4:kategorie
n19:ZV
n4:klicovaSlova
viroid; viroid; disease; gene; silencing; miRNA; transcription; factors; H.; lupulus; S.; lycopersicum
n4:partnetrHlavni
n14:ico%3A60077344
n4:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n4:pocetPrijemcu
1
n4:pocetSpoluPrijemcu
0
n4:pocetVysledkuRIV
9
n4:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
9
n4:posledniUvolneniVMinulemRoce
2012-03-30+02:00
n4:prideleniPodpory
n10:P501%2F10%2FJ018
n4:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n16:2012
n4:sberDatUdajeProjZameru
n16:2013
n4:soutez
n20:SGA02010GA1GC
n4:statusZobrazovaneFaze
n5:DUU
n4:typPojektu
n11:P
n4:ukonceniReseni
2012-12-31+01:00
n4:vedlejsiObor
n6:ED n6:GF
n4:zahajeniReseni
2010-01-01+01:00
n4:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Final report is carefully written and contains all required information. The project was executed at high level and lead to novel results on pathogenic effects of viroids and a multitargeting model of pathogenesis was confirmed that leads to aberrant function of regulatory networks. The results were published in 3 scientific journals with impact factor and on several scientific conferences. Závěrečná zpráva je pečlivě vypracována a obsahuje všechny náležitosti. Projekt byl řešen na výborné úrovni a byly získány původní poznatky o patogenním účinku viroidů a byla potvrzena hypotéza o mnohočetném cílení molekul, které vede k poruchám regulačních sítí. Výsledky projektu byly zveřejněny ve 3 vědeckých časopisech s impakt faktorem a na řadě vědeckých konferencí.
n4:zivotniCyklusProjektu
n18:ZBKU
n4:klicoveSlovo
gene H. silencing factors miRNA lupulus viroid S. transcription viroid disease