This HTML5 document contains 39 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n22http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP501%2F10%2F0102/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n18http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP501%2F10%2F0102
rdf:type
n20:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP501/10/0102
dcterms:description
Studium evolučně mladých pohlavních chromozomů rostlin představuje objasňování časných stádií vývoje chromozomů člověka. Tento projekt navazuje na dosavadní výsledky naší laboratoře, kdy jsme provedli strukturní a cytogenetickou analýzu pohlavních chromozomů Silene latifolia. Pohlavní chromozomy Rumex acetosa jsou zjevně fylogeneticky starší a mají heterochromatický charakter. Metodou 454-sekvenování provedeme základní charakteristiku samčího a samičího genomu R. acetosa a pomocí laserového mikromanipulátoru připravíme DNA-knihovny pohlavních chromozomů. Analýzou X-knihovny připravíme genové sekvence a budeme hledat jejich alely na chromozomech Y. Předpokládáme, že u R. acetosa došlo k rozsáhlejším degenerativním změnám než u S. latifolia. Kvantitativní RT-PCR analýza genové exprese u obou modelů by měla odhalit (a) rozdíly v expresi X- a Y-vázaných alel, (b) rozdíly v expresi těchto genů u odlišných pohlaví a (c) rozdíly v různě starých fylogenetických systémech pohlavních chromozomů. Plant sex chromosomes are rarely heteromorphic and they seem to be evolutionary younger compared to most animal species. So when studying the structure and evolution of plant sex chromosomes we can analyse the first steps in evolution of human sex chromosomes. We have already characterised the sex chromosomes of Silene latifolia and well documented that the Y accumulates many types of repetitive sequences. There are two Y chromosomes in males of Rumex acetosa and appear to be heterochromatic and probably of an older evolutionary age. In this project we want to globally characterise the sorrel genome using the 454-sequencing strategy, and using BAC library and laser microdissection we will isolate some X-linked genes and look for their Y-alleles. The aim of this work is to functionally analyse  X- and Y-linked genes in both experimental plant models (campion and sorrel) in order to demonstrate (a) a different extent of degeneration of the Y chromosome(s), (b) to compare gene expression in different sexes, and (c) to indicate a hypothetical dosage compensation system.
dcterms:title
Srovnávací analýza pohlavních chromozomů rostlin Comparative Analysis of Plant Sex Chromosomes
skos:notation
GAP501/10/0102
n4:aktivita
n21:GA
n4:celkovaStatniPodpora
n7:celkovaStatniPodpora
n4:celkoveNaklady
n7:celkoveNaklady
n4:datumDodatniDoRIV
2015-05-22+02:00
n4:druhSouteze
n5:VS
n4:duvernostUdaju
n9:S
n4:fazeProjektu
n10:100894944
n4:hlavniObor
n8:EB
n4:hodnoceniProjektu
n16:V
n4:kategorie
n12:ZV
n4:klicovaSlova
sex chromosomes dioecious plants,structure physical mapping gene expression
n4:partnetrHlavni
n15:ico%3A68081707
n4:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n4:pocetPrijemcu
1
n4:pocetSpoluPrijemcu
0
n4:pocetVysledkuRIV
13
n4:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
13
n4:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-03-19+01:00
n4:prideleniPodpory
n22:P501-10-0102
n4:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n18:2014
n4:sberDatUdajeProjZameru
n18:2015
n4:soutez
n13:SGA02010GA-ST
n4:statusZobrazovaneFaze
n11:DUU
n4:typPojektu
n6:P
n4:ukonceniReseni
2014-12-31+01:00
n4:vedlejsiObor
n8:EF n8:GE
n4:zahajeniReseni
2010-01-01+01:00
n4:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Projekt mimořádně přispěl k základnímu výzkumu rostlin studiem komplexních aspektů organizace sex chromozómů u S. lativolia a R. acetosa jako dimofismus, zjištění plastidové DNA v chromozómu Y, absence retroelementů na Y chromozómu jako epigenetická adaptace, distribuce repetetivních sekvencí. Cíle projektu byl zcela splněny. Bylo publikováno celekm 14 impaktových prací a jedna knižní publikace. The project successfully studied several complex aspects on S. latifolia and R. acetosa sex chromosomes like dimophism, repetitive sequences, distribution of plastid DNA in Y chromosome, absence of retroelements in Y chromosome as epigenetic mechanism. The taks of the project was fully accomplished. Based on this project, 14 impact papers and one book publication were published.
n4:zivotniCyklusProjektu
n14:ZBBBKU
n4:klicoveSlovo
sex chromosomes dioecious plants