This HTML5 document contains 38 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F1095/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n22http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n6http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP305%2F11%2F1095
rdf:type
n13:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/11/1095
dcterms:description
Degradace RNA v eukaryotech hraje klíčovou úlohu v regulaci genové exprese. Jedním z nezbytných faktorů procesování a degradace 3 konců RNA je proteinový komplex zvaný exosom. Ačkoli jeho jádro tvoří šest potenciálních exoribonukleáz, ani jedna z nich si nezachovala enzymatickou aktivitu. Jedinou katalyticky aktivní podjednotkou je protein Rrp44p nebo také Dis3p, jehož funkce a aktivity byly dosud podrobně popsány pouze u kvasinek. Savčí buňky kódují 3 sekvenční homology kvasinkové Rrp44p: DIS3, DIS3L a DIS3L2. Poslední ze zmíněných proteinů se zdá být nejodlišnější, jelikož postrádá doménu, která je v kvasinkové Rrp44p zodpovídá za vazbu na celý zbytek exosomu a její absence je letální. Cílem tohoto projektu je detailní studium funkce DIS3L2 v lidských tkáňových kulturách, charakterizace jeho substrátového repertoáru RNA a biochemická charakterizace enzymatických a vazebných aktivit na RNA. Vzhledem ke klíčové úloze Rrp44p v kvasinkách předpokládáme, že každý ze tří zmíněných homologů bude mít významnou úlohu na buněčné i organismální úrovni u savců.  RNA trimming and turnover plays a key role in eukaryotic gene expression regulation. The degradation and trimming at RNA 3-prime ends is catalyzed by an essential protein complex called the exosome. Although, the exosome core includes six potential exoribonucleases, none of them is catalytically active. The main and only active component is the tenth subunit Rrp44p/Dis3p. Its function and activities have only been described in detail in yeast. Mammalian cells encode three Rrp44p sequence homologs; DIS3, DIS3L and DIS3L2. DIS3L2 is the least similar because it lacks the PIN domain, which is in yeast responsible for binding the exosome core and is essential for viability. The aim of this proposal is to investigate in detail DIS3L2 function in human cells, to characterize the RNA substrate repertoir and to describe the biochemical properties such as enzymatic activities and RNA affinity. In regard to the role of Rrp44p in yeast we expect that all three human homologs will have essential roles for cell and organism function in mammals.
dcterms:title
Functional and biochemical characterization of Dis3L2, the third mammalian homolog of the key yeast exosome nuclease Dis3p Funkční a biochemická charakterizace proteinu Dis3L2, třetího lidského homologu hlavní kvasinkové exosomové nukleázy Dis3p
skos:notation
GAP305/11/1095
n4:aktivita
n16:GA
n4:celkovaStatniPodpora
n18:celkovaStatniPodpora
n4:celkoveNaklady
n18:celkoveNaklady
n4:datumDodatniDoRIV
2015-05-22+02:00
n4:druhSouteze
n9:VS
n4:duvernostUdaju
n14:S
n4:fazeProjektu
n8:100902881
n4:hlavniObor
n5:EB
n4:hodnoceniProjektu
n17:V
n4:kategorie
n11:ZV
n4:klicovaSlova
RNA degradation 3' to 5' exonuclease Rrp44p Dis3p exosome
n4:partnetrHlavni
n21:orjk%3A14740
n4:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n4:pocetPrijemcu
1
n4:pocetSpoluPrijemcu
0
n4:pocetVysledkuRIV
4
n4:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
4
n4:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-04-18+02:00
n4:prideleniPodpory
n12:P305-11-1095
n4:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n6:2014
n4:sberDatUdajeProjZameru
n6:2015
n4:soutez
n22:SGA02011GA-ST
n4:statusZobrazovaneFaze
n15:DUU
n4:typPojektu
n7:P
n4:ukonceniReseni
2014-12-31+01:00
n4:vedlejsiObor
n5:CE n5:EB
n4:zahajeniReseni
2011-01-01+01:00
n4:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
The project was fulfilled in an excellent way and yielded important new knowledge on the role of DIS3L2 as an exonuclease specifically targeting uridylated microRNA, revealing the role of uridinylation in the metabolism of RNA in the cell. The tree published papers (in high quality journals like Genes & Development, Nucleic Acids Research, RNA) received high attention of the research community. Projekt byl splněn skvělým způsobem a byly získány významné výsledky. Byla odhalena aktivita DIS3L2 jako exonukleázy specificky targetující uridylované formy microRNA a další výsledky ukazují na významnou roli uridylace v metabolismu RNA a fyziologii buňky. Byly již publikovány 3 významné práce ve vynikajících časopisech a další je v revizi pro Nucleic acid Research.
n4:zivotniCyklusProjektu
n10:ZBBKU