This HTML5 document contains 36 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F10%2F0930/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n11http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP305%2F10%2F0930
rdf:type
n19:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/10/0930
dcterms:description
The existence and evolution of sex chromosomes is a basic question in evolutionary biology. The Y chromosome is a bizarre part of the genomes, non-recombining, what results in its degeneration and accumulation of repetitive DNA, mostly transposable elements. We will study dynamics of transposable elements on young sex chromosomes of dioecious plant Silene latifolia. First, we will characterize all abundant repetitive elements using our recent 454 sequencing data. Comparison of male and female genomes will reveal elements accumulated on the Y chromosome, what will be confirmed by FISH mapping. Comparison of transposable elements amplified on microdissected sex chromosomes combined with studies of their expression patterns will enable us to decide how active are elements on the sex chromosomes. Together with identification of transposable elements within genes on degenerating Y chromosome and determination of their age give us a detailed picture of the role of transposable elements in shaping genomic and transcriptomic landscape of the young degenerating Y chromosome. Vznik a evoluce pohlavních chromosomů je jednou ze základních otázek evoluční biologie. Unikátní je především chromosom Y, představující zvláštní část genomu, která nerekombinuje. Výsledkem je jeho degenerace a akumulace repetitivní DNA, zejména transposonů. Budeme studovat dynamiku transposonů u mladých pohlavních chromosomů dvoudomé rostliny Silene latifolia. S použitím našich recentních dat z 454 sekvenování budeme nejprve charakterizovat hlavní repetitivní elementy. Srovnáním samčího a samičího genomu odhalíme elementy akumulované na chromosomu Y, což bude ověřeno pomocí FISH. Porovnání transposonů amplifikovaných na mikrodisektovaných chromosomech, v kombinaci se sledováním jejich exprese, nám umožní zjistit, jak aktivní jsou elementy nacházející se na pohlavních chromosomech. To nám pak spolu s identifikací transposonů v genech na degenerujícím chromosomu Y, a určením jejich stáří, poskytne podrobný obrázek úlohy transposonů ve formování genomové a transkriptomové krajiny mladého degenerujících chromosomu Y. Grant je pokračováním grantu GAČR 204/05/2097.
dcterms:title
Pohlavní chromosomy a dynamika transposonů Sex chromosomes and dynamics of transposable elements
skos:notation
GAP305/10/0930
n3:aktivita
n16:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n12:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n12:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-05-22+02:00
n3:druhSouteze
n22:VS
n3:duvernostUdaju
n6:S
n3:fazeProjektu
n17:100901157
n3:hlavniObor
n4:EB
n3:hodnoceniProjektu
n9:V
n3:kategorie
n7:ZV
n3:klicovaSlova
sex chromosomes transposable elements expression degeneration
n3:partnetrHlavni
n13:ico%3A68081707
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
12
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
12
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-03-31+02:00
n3:prideleniPodpory
n5:P305-10-0930
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n11:2014
n3:sberDatUdajeProjZameru
n11:2015
n3:soutez
n15:SGA02010GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n18:DUU
n3:typPojektu
n10:P
n3:ukonceniReseni
2014-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2010-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
The results of this project enhanced in a significant manner our knowledge of the evolution of sex chromosomes and the behaviour of dynamic components of plant genomes - transposons, microsatellites and promiscuous DNA. These data were published in 14 papers and one monograph chapter. Výsledky tohoto projektu zásadním způsobem rozšířily naše znalosti o evoluci pohlavních chromozomů a o chování dynamických složek rostlinných genomů – transposonů, mikrosatelitů a promiskuitní DNA. Tato data byla publikována ve 14 článcích a jedné kapitole v zahraniční monografii.
n3:zivotniCyklusProjektu
n14:ZBBBKU