This HTML5 document contains 36 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F10%2F0424/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n4http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP305%2F10%2F0424
rdf:type
n9:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/10/0424
dcterms:description
Alternativní sestřih (AS) je jedním z klíčových kroků při expresi genů, který výrazným způsobem rozšiřuje množství proteinů kódovaných naším genomem. Sestřih je regulován velkým souborem různých faktorů, ale jen omezené množství AS bylo vysvětleno vazbou mezi sestřihovými regulátory a cílovou pre-mRNA. V tomto projektu navrhujeme zkoumat dosud nepopsanou regulaci AS pomocí acetylace chromatinu. Naše předběžné výsledky ukazují, že inhibice nebo odstranění histonových deacetyláz vede ke změnám AS několika savčích genů. V první řadě navrhujeme identifikovat pomocí exonových DNA čipů další ovlivněné geny. Bylo ukázáno, že sestřihové faktory asociují s cílovou nascentní pre-mRNA již během transkripce. V tomto návrhu chceme otestovat hypotézu, že modifikace histonů ovliňují vazbu sestřihových faktorů s nascentní pre-mRNA. Budeme též testovat alterantivní hypotézu předpokládající, že acetylace chromatinu ovlivňuje rychlost RNA polymerázy II a to vede ke změnám v AS. Nakonec navrhujeme zkoumat roli acetylace histonů při regulaci AS během diferenciace svalových buněk. Alternative splicing (AS) is one of the key steps in gene expression that greatly increases coding potential of our genome. Splicing is regulated by numerous factors but only a limited number of AS events were explained by interaction among splicing regulators and target pre-mRNAs. In this project, we propose to explore a novel mechanism of splicing regulation via chromatin acetylation. Our substantial preliminary data show that inhibition or depletion of histone deacetylases influences a splice-site choice of several mammalian genes. First, we plan to identify additional target genes by DNA exon arrays. It has been shown that splicing factors associate with nascent pre-mRNA during transcription. We propose to follow a hypothesis that histone modifications alter association of splicing factors with nascent pre-mRNA. We will also pursue an alternative hypothesis assuming that chromatin acetylation change speed of RNA polymerase II, which in turn change AS outcome. Finally, we will analyze a role of histone aceylation in AS during muscle cell differentiation.
dcterms:title
Regulation of alternative splicing via chromatin acetylation Vliv acetylace chromatinu na regulaci alternativního sestřihu
skos:notation
GAP305/10/0424
n3:aktivita
n15:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n5:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n5:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-07-01+02:00
n3:druhSouteze
n19:VS
n3:duvernostUdaju
n12:S
n3:fazeProjektu
n20:100268135
n3:hlavniObor
n21:EB
n3:hodnoceniProjektu
n18:V
n3:kategorie
n17:ZV
n3:klicovaSlova
pre-mRNA splicing alternative splicing chromatin histones acetylation
n3:partnetrHlavni
n13:ico%3A68378050
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
4
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
4
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2013-06-07+02:00
n3:prideleniPodpory
n14:P305-10-0424
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n4:2013
n3:sberDatUdajeProjZameru
n4:2014
n3:soutez
n8:SGA02010GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n16:DUU
n3:typPojektu
n7:P
n3:ukonceniReseni
2013-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2010-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
1. The main contribution is represented by the description how histone acetylation affects alternative splicing. 2. Investigator's data are relevant. 3. Significance for our understanding of functions of organisms. 4. Very good publication outcomes (3 publications in journals with a decent IF). 5. I did not notice. 1. Hlavním přínosem je popsání, jak acetylace histonů ovlivňuje alternativní sestřih. 2. Údaje řešitele jsou adekvátní. 3. Význam pro pochopení fungování organismů. 4. Velmi dobré publikační výstupy (3 publikace v časopisech se slušným IF). 5. Nezaregistroval jsem.
n3:zivotniCyklusProjektu
n22:ZBBKU