This HTML5 document contains 37 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP302%2F11%2F0855/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n7http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP302%2F11%2F0855
rdf:type
n20:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP302/11/0855
dcterms:description
Porozumění molekulárnímu aparátu bakteriální buňky je klíčové pro vývoj nových antibakteriálních látek. RNA polymeráza (RNAP) je esenciální pro genovou expresi. V současnosti jsme vyřešili strukturu podjednotky delta RNAP a objasnili její fyziologickou roli. V průběhu těchto studií jsme identifikovali proteiny, které interagují s touto podjednotkou nebo s bakteriální RNAP. V tomto projektu navrhujeme studovat strukturně-funkční vztahy těchto proteinů: (i) omega1, dosud nestudovaná podjednotka RNAP; (ii) TRAP, extenzivně studovaný protein jehož přítomnost na RNAP nebyla dosud popsána a jenž jsme identifikovali na RNAP; (iii) SP_2234, protein o neznámé funkci, který jsme identifikovali jako interakčního partnera podjednotky delta; (iv) YvgS, helikázu, kterou jsme identifikovali jako vázající se na RNAP. Navrhovaný výzkum bude zaměřen na určení fyziologické role interakcí těchto proteinů s RNAP za použití biochemických, genetických a strukturních přístupů. Tento projekt prohloubí naše znalosti o RNAP jako molekule, kde konvergují různé signály, jsou interpretovány, a ovlivňují transkripční výstup. Nové znalosti získané v tomto projektu mohou pak pomoci při vývoji nových antibakteriálních látek zacílených na RNAP. Understanding the key molecular players in bacteria is crucial for the development of novel antibacterial compounds. RNA polymerase (RNAP) is essential for gene expression. Recently, we have solved the structure of the delta subunit of RNAP from Bacilus subtilis and unraveled its cellular role. In the course of these studies we identified a protein interacting with delta as well as other proteins interacting with RNAP. Here, we propose to study the structure-function relationship of RNAP from Bacillus subtilis with the following proteins: (i) omega1, a subunit of RNAP of which little is known; (ii) TRAP, an extensively studied protein involved in amino acid metabolism whose interaction with RNAP was previously unsuspected; (iii) SP_2234, a protein of unknown function that we identified to interact with delta; and (iv) Yvgs, a putative helicase that we identified to interact with RNAP. The proposed project will investigate the physiological role(s) of interactions of these proteins with RNAP by biochemical, genetic, and structural approaches. The project will advance our understanding of RNAP as a hub where various types of signals converge, are interpreted, and affect the transcriptional output. The new knowledge may aid in designing novel antibacterial compounds targeting RNAP and its function.
dcterms:title
RNA polymerase: The “meeting point” of regulatory networks RNA polymeráza: Průsečík regulačních sítí
skos:notation
GAP302/11/0855
n3:aktivita
n13:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n14:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n14:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-05-22+02:00
n3:druhSouteze
n12:VS
n3:duvernostUdaju
n8:S
n3:fazeProjektu
n22:100904303
n3:hlavniObor
n5:EE
n3:hodnoceniProjektu
n4:V
n3:kategorie
n9:ZV
n3:klicovaSlova
RNA polymerase gene expression interaction partners protein structure
n3:partnetrHlavni
n15:ico%3A61388971
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
1
n3:pocetVysledkuRIV
7
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
7
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-04-28+02:00
n3:prideleniPodpory
n16:P302-11-0855
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n7:2014
n3:sberDatUdajeProjZameru
n7:2015
n3:soutez
n6:SGA02011GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n19:DUU
n3:typPojektu
n11:P
n3:ukonceniReseni
2014-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n5:EB
n3:zahajeniReseni
2011-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Projekt byl zaměřen na objasnění funkce nově identifikovaných faktorů interagujících s RNA polymerázou. Údaje na závěrečné kartě projektu jsou validní a adekvátní. Tento projekt významně rozšířil naše znalosti o bakteriálních transkripčních faktorech i transkripci obecně. Výsledky byly publikovány v odborných časopisech, 8x s IF Řešení projektu bylo v souladu s pravidly. Project was focused on functional evaluation of newly identified factors interacting with RNA polymerase. The data in final report are valid and adequate. This project significantly increased our knowledge about bacterial TFs and transcription in general. There were 8 papers in prestigious journals with IF. Řešení projektu a čerpání prostředků bylo v souladu s pravidly.
n3:zivotniCyklusProjektu
n21:ZBBKU