This HTML5 document contains 34 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP208%2F12%2F1878/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n13http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP208%2F12%2F1878
rdf:type
n20:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP208/12/1878
dcterms:description
Nekódující RNA hrají zásadní úlohu při údržbě, regulaci a modifikaci genetické informace. Klíčovými molekulami jsou RNA enzymy (ribozymy), které mají významné biologické a biotechnologické funkce. Přesto více než čtvrt století po jejich objevu jsou znalosti o RNA katalýze nedostatečné ve srovnání s katalytickými bílkovinami. Projekt navrhuje výrazný krok vpřed ve fyzikálně-chemickém pochopení RNA katalýzy. Je založen na integrované aplikaci nejmodernějších počítačových metod, především masívní aplikaci klasických a kvantově-klasických simulací. Bude určena použitelnost a limitace metod, včetně jejich testování a adjustace. Studovány budou tři nejlépe krystalograficky a biochemicky charakterizované RNA enzymy, vlásenkový, HDV a glmS ribozym. Projekt dále zahrnuje CRISPR Csy4 endonukleázu, což je bílkovina, jež rovněž katalyzuje štěpení cukr-fosfátové páteře RNA. Tento interdisciplinární projekt bude mít podstatný přínos k základnímu pochopení fyzikální chemie RNA katalýzy na atomární úrovni a přispěje rovněž k vývoji moderních počítačových metod vhodných ke studiu RNA. The non-coding RNAs play decisive roles in expression and regulation of genetic information. Among them catalytic RNAs (ribozymes) have high biological and biotechnological relevance. Still, more than a quarter-century after their discovery, the understanding of physical-chemistry of RNA catalysis lags behind that of proteins. The project suggests major step forward in physical-chemistry understanding of RNA catalysis, based on integrated application of state-of-the art computational tools, mainly large-scale classical and quantum-classical simulations. Applicability and limitations of the methodology will be established, including its tuning. Three crystallographically and biochemically best characterized small ribozymes, the hairpin, hepatitis delta virus and glmS ribozymes will be studied and complemented by study of protein CRISPR Csy4 endonuclease, which also catalyzes RNA self-cleavage. The interdisciplinary project will improve atomistic-resolution understanding of the RNA catalysis and contribute to the development of advanced computational tools to tackle RNA.
dcterms:title
Katalytická strategie RNA a RNP enzymů studovaná širokým spektrem výpočetních metod Catalytic strategies of RNA and RNP enzymes studied by multi-scale computational approach
skos:notation
GAP208/12/1878
n3:aktivita
n18:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n8:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n8:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n3:druhSouteze
n21:VS
n3:duvernostUdaju
n12:S
n3:fazeProjektu
n16:100773184
n3:hlavniObor
n10:CF
n3:kategorie
n11:ZV
n3:klicovaSlova
RNA enzyme catalysis QM/MM quantum chemistry molecular dynamics
n3:partnetrHlavni
n7:ico%3A68081707
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
1
n3:pocetVysledkuRIV
16
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
16
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-04-23+02:00
n3:prideleniPodpory
n19:P208-12-1878
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n13:2015
n3:sberDatUdajeProjZameru
n13:2015
n3:soutez
n5:SGA02012GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n15:DRRVB
n3:typPojektu
n4:P
n3:ukonceniReseni
2016-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n10:BO
n3:zahajeniReseni
2012-01-01+01:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n6:ZBBB