This HTML5 document contains 34 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP208%2F11%2F0295/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n11http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP208%2F11%2F0295
rdf:type
n4:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP208/11/0295
dcterms:description
Vyvinutí rychlé a přesné metody pro počítačové návrhy nových léků na základě semiempirické kvantově chemické metody PM6-DH2 správně popisující různé typy nekovalentních interakcí. Kromě interakční entalpie a entropie, je zahrnuta též deformační a solvatační volná energie ligandu i receptoru. Virtual screening by molecular docking is a widely used strategy in rational drug design. The binding affinity is estimated by a scoring function which accurately describes protein-ligand binding. We introduce a reliable re-scoring scheme of docked complexes based on an advanced semiempirical quantum mechanical PM6-DH2 method (with corrections for dispersion and hydrogen bonds) yielding accurate results for various types of noncovalent interactions. The total score is constructed as the sum of the interaction enthalpy, interaction entropy, sum of deformation energy and the desolvation  free energy of the ligand and protein. Main advantage of the procedure is the fact that knowledge of any empirical parameter either for individual component of the total score or for individual protein...ligand complex is not required. This re-scoring method will be first verified toward challenging systems like the HIV-1 protease or CDK2 kinase with a set of ligands for which experimental data are availbale. Finally, the technique will be used for rational drug discovery and de novo ligand design.
dcterms:title
Počítačové návrhy léků založené na pokročilých semiempirických kvantově chemických metodách přesně popisujících nekovalentní interakce In silico drug design based on advanced semiempirical quantum mechanical methods accurately describing noncovalent interactions
skos:notation
GAP208/11/0295
n3:aktivita
n12:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n14:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n14:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2012-03-30+02:00
n3:druhSouteze
n10:VS
n3:duvernostUdaju
n18:S
n3:fazeProjektu
n20:82093990
n3:hlavniObor
n7:CF
n3:kategorie
n19:ZV
n3:klicovaSlova
Počítačové návrhy léků, semiempirický kvantově mechanický Hamiltonián PM6, nekovalentní interakce
n3:partnetrHlavni
n16:ico%3A61388963
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
6
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
6
n3:prideleniPodpory
n8:P208%2F11%2F0295
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n11:2011
n3:sberDatUdajeProjZameru
n11:2011
n3:soutez
n15:SGA02011GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n17:DRRVZ
n3:typPojektu
n9:P
n3:ukonceniReseni
2015-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2011-01-01+01:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n21:Z
n3:klicoveSlovo
semiempirický kvantově mechanický Hamiltonián PM6 Počítačové návrhy léků