This HTML5 document contains 36 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP208%2F10%2F0725/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n16http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:GAP208%2F10%2F0725
rdf:type
n7:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP208/10/0725
dcterms:description
Interactions in molecular solids display an intricate balance between dispersion, electrostatic, and exchange forces. This situation is not particularly favorable for the widely used density functional theory (DFT) approaches employing the local density functionals (LDA, GGA). DFT calculations typically fail to describe dispersive (van der Waals) molecular systems. Many examples occur in organic (aromatic) crystals and graphitic nanomaterials with intermolecular π-π interactions. A proper description of the π-π stacking interactions is also essential for many biologically relevant molecules (e.g. DNA, RNA, proteins). Recently, a novel DFT/CC correction scheme has been proposed in our laboratory for precise calculations of weakly bound molecular solids (O. Bludsky et al., J. Chem. Phys., 128, 114102 (2008)). The DFT/CC method was tested for well-studied systems, both from the theoretical and experimental point of view. The main emphasis of this project is to develop theoretical methods for precise description of intermolecular interactions in molecular solids, and, in turn, from an accurate parameterization of the DFT/CC correction scheme obtain valuable information on interactions in proteins. Fyzikálně korektní popis mezimolekulových interakcí je zcela zásadní pro pochopení struktury a vlastností biologicky relevantních systémů, jako jsou např. DNA, RNA a proteiny. Interakce v těchto systémech jsou dány jemnou rovnováhou disperzních, elektrostatických a výměnných sil, kterou běžně používané kvantově chemické metody založené na lokálních funkcionálech hustot (LDA, GGA metody) nedokáží popsat. Četné příklady selhání DFT výpočtů lze najít v organických (aromatických) krystalech nebo grafitických nanomateriálech s intermolekulárními π-π interakcemi. Jedno z možných řešení výše zmíněného problému představuje DFT/CC korekční metoda vyvinutá na našem pracovišti (O. Bludský et al., J. Chem. Phys., 128, 114102 (2008)). Tato metoda umožňuje velmi přesný popis π-π interakcí v molekulových krystalech a byla již úspěšně testována na řadě teoreticky i experimentálně dobře prostudovaných systémů (grafit, benzen, C60). Projekt "Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech" bude zaměřen na využití DFT/CC metody pro řadu modelových systémů. Výsledky těchto studií budou poté aplikovány pro charakterizaci mezimolekulových interakcí proteinů.
dcterms:title
Intermolecular Interactions in Molecular Solids and Proteins Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech
skos:notation
GAP208/10/0725
n3:aktivita
n10:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n4:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n4:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-07-01+02:00
n3:druhSouteze
n22:VS
n3:duvernostUdaju
n19:S
n3:fazeProjektu
n5:100265612
n3:hlavniObor
n6:CF
n3:hodnoceniProjektu
n14:V
n3:kategorie
n17:ZV
n3:klicovaSlova
intermolecular interactions proteins
n3:partnetrHlavni
n13:ico%3A61388963
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
1
n3:pocetVysledkuRIV
11
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
11
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2013-06-12+02:00
n3:prideleniPodpory
n20:P208-10-0725
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n16:2013
n3:sberDatUdajeProjZameru
n16:2014
n3:soutez
n15:SGA02010GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n8:DUU
n3:typPojektu
n21:P
n3:ukonceniReseni
2013-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2010-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Project devoted to the design of theoretical models and methods of intermolecular interactions in complex molecular systems was completed according to the plan. It provided significant results in methodology and applications, particularly description of weakly bound molecular systems and biomolecular interactions. The results were published in 10 papers in impacted journals and one book chapter. Projekt zabývající se vývojem teoretických modelů a metod mezimolekulových interakcí v komplexních molekulových systémech byl řešen v souladu s plánem. Byly dosaženy významné výsledky v oblasti metodologické i aplikační, zejména v popisu slabě vázaných molekulových systémů a biomolekulárních interakcí. Výsledky byly shrnuty v 10 publikacích v impaktovaných časopisech a v jedné kapitole v knize.
n3:zivotniCyklusProjektu
n12:ZBBKU