This HTML5 document contains 35 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP207%2F11%2F0717/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n10http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GAP207%2F11%2F0717
rdf:type
n17:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP207/11/0717
dcterms:description
Protein splicing is a unique mechanism of autocatalytic protein editing directly at polypeptide level. Recently, we identified a calcium-dependent self-processing module (SPM) inside the FrpC protein of Neisseria meningitidis that mediates autocatalytic cleavage of the Asp-Pro peptide bond and formation of an isopeptide bond of the newly released carboxyl of the Asp residue with ε-amino group of adjacent Lys residue (protein trans-splicing). The aim of this project is to determine the structure-function relationships underlying the mechanism of SPM-based protein splicing and its potential use in protein engineering. The project will focus on determination of the three-dimensional structure of SPM, which enables a deeper insight into a novel type of autocatalytic cleavage of the Asp-Pro peptide bond and the role of calcium ions in the conformational change of SPM during autocatalytic processing. The capacity of the newly generated fragment to form covalent linkage with amine group will be exploited for development of SPM-based protein ligation technology. Sestřih proteinu je posttranslační modifikace proteinů založená na unikátním mechanismu autokatalytického štěpení výchozího polypeptidu a následnému spojení rozštěpených fragmentů pomocí peptidové vazby. V nedávné době jsme objevili novou navápníku závislou samoštěpící doménu (SPM) proteinu FrpC z Neisseria meningitidis, která je schopna rozštěpit peptidovou vazbu mezi aminokyselinami Asp aPro, a zároveň umožňuje vytvořit izopeptidovou vazbu mezi karboxylovou skupinouAsp odštěpeného proteinu a ε-amino skupinou na okolním lysinu (proteinovýsestřih in trans). Cílem tohoto projektu je objasnit strukturní a funkční charakteristiky proteinového sestřihu založeného na SPM a jeho potenciální využití v proteinovém inženýrství. Trojrozměrná struktura SPM umožní detailní pohled na mechanismus autokatalytického štěpení Asp-Pro vazby a zároveň pomůže objasnit úlohu vápenatých iontů v tomto procesu. Schopnosti odštěpeného fragmentu reagovat s okolními primárními aminy bude využito na vývoj alternativního přístupu k chemické modifikaci proteinů založené na SPM.
dcterms:title
Molekulární mechanismus autokatalytického proteinového sestřihu RTX proteinu FrpC z Neisseria meningitidis Molecular mechanism of autocatalytic protein splicing of the RTX protein FrpC from Neisseria meningitidis
skos:notation
GAP207/11/0717
n4:aktivita
n14:GA
n4:celkovaStatniPodpora
n11:celkovaStatniPodpora
n4:celkoveNaklady
n11:celkoveNaklady
n4:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n4:druhSouteze
n18:VS
n4:duvernostUdaju
n20:S
n4:fazeProjektu
n21:100775985
n4:hlavniObor
n15:CE
n4:kategorie
n5:ZV
n4:klicovaSlova
trans-splicing autocatalytic processing activation by calcium NMR X-ray crystallography
n4:partnetrHlavni
n8:ico%3A61388971
n4:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n4:pocetPrijemcu
1
n4:pocetSpoluPrijemcu
1
n4:pocetVysledkuRIV
7
n4:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
7
n4:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-04-23+02:00
n4:prideleniPodpory
n13:P207-11-0717
n4:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n10:2015
n4:sberDatUdajeProjZameru
n10:2015
n4:soutez
n19:SGA02011GA-ST
n4:statusZobrazovaneFaze
n16:DRRVK
n4:typPojektu
n6:P
n4:ukonceniReseni
2015-12-31+01:00
n4:vedlejsiObor
n15:EB n15:EE
n4:zahajeniReseni
2011-01-01+01:00
n4:zivotniCyklusProjektu
n7:ZBBBK