This HTML5 document contains 35 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA310%2F03%2F1091/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n5http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA310%2F03%2F1091
rdf:type
n10:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA310/03/1091
dcterms:description
Koliciny jsou toxické exoproteiny produkované některými kmeny čeledi Enterobacteriaceae. Vysoce specifické interakce kolicinového proteinu s komponentami bakteriálního obalu podmiňují vysokou (téměř absolutní) letální účinnost a specifitu těchto molekul.Snadná detegovatelnost kolicinového účinku na citlivé bakterie předurčuje kolicinový výzkum jako modelový pro studium interakce proteinů s komponenty bakteriální buňky. Navrhujeme studovat interakci kolicinu U s receptorovým proteinem OmpA. OmpA receptormá oproti jiným proteinům zevní membrány řadu výhod: jeho krystalová struktura je známa, je přítomen v monomerní formě, 170 N-terminálních aminokyselinových zbytků kóduje transmembránovou část proteinu a mutantní OmpA proteiny s delecí každé ze čtyřindividuálních extracelulárních kliček byly zkonstruovány. Cílem projektu je identifikace aminokyselinových zbytků OmpA proteinu a kolicinu U, které spolu navzájem interagují a definice vazebných epitopů. Dále navrhujeme studovat interakci imunitního Colicins are exocellular bacterial protein toxins produced by some bacterial strains of the family Enterobacteriaceae. Their highly efficient ability to kill sensitive bacteria is facilitated by highly specific interactions between colicin molecule andthe cell envelope proteins (and other components) of sensitive bacterium. Although colicins have been extensively studied in the past decades, little is known about the colicin recognition of outer membrane receptor and inhibition of colicin killingactivity by their cognate immunity proteins synthesized by producer bacteria. Here we propose to characterize the colicin-receptor and colicin-immunity protein interactions. We propose to use colicin U and OmpA protein as a model for colicin-receptorinteractions because of the significant advantages of this study system. The residues of OmpA protein involved in colicin U binding will be identified and the binding assays will be used to differentiate between binding and the ability to mediate the
dcterms:title
Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem
skos:notation
GA310/03/1091
n3:aktivita
n16:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n9:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n9:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2009-01-15+01:00
n3:druhSouteze
n14:VS
n3:duvernostUdaju
n17:S
n3:fazeProjektu
n20:33436151
n3:hlavniObor
n8:EB
n3:hodnoceniProjektu
n15:V
n3:kategorie
n18:ZV
n3:klicovaSlova
Neuvedeno.
n3:partnetrHlavni
n4:orjk%3A14110
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
17
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
17
n3:rokUkonceniPodpory
n5:2005
n3:rokZahajeniPodpory
n5:2003
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n5:2006
n3:sberDatUdajeProjZameru
n5:2006
n3:soutez
n21:SGA02003GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n19:DUU
n3:typPojektu
n12:P
n3:vedlejsiObor
n8:EE
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Interaction sites of OmpA protein, colicins U and Y and their cognate immunity proteins (Cui and Cyi, respectively) were mapped.Three amino acid residues that interact with colicin U molecule were identified in the receptor protein OmpA: I45 (localized i Byla zmapována interakční místa v proteinu OmpA, kolicinů U a Y a na imunitních proteinech kolicinů U a Y.Byly identifikovány 3 aminokyselinové zbytky v proteinu OmpA, které interagují s kolicinem U. Vedle I45 je dalším zásadním aminokyselinovým zbytkem,
n3:zivotniCyklusProjektu
n6:ZBKU