This HTML5 document contains 42 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n22http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA303%2F09%2F1168/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n19http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:GA303%2F09%2F1168
rdf:type
n10:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA303/09/1168
dcterms:description
Specifické rozpoznávání sacharidů na povrchu buněk hraje důležitou úlohu v rozlišení hostitele patogenními organismy. Projekt je zaměřen na strukturně-funkční charakterizaci dosud identifikovaných proteinů z podmíněných lidských patogenů a také proteinů, které budou nalezeny v nově sekvenovaných genomech. Vybrané proteiny budou  klonovány a exprimovány v rekombinační podobě. Specifita a afinita lektinů s biologicky zajímavými oligosacharidy bude studována pomocí metod resonance povrchových plasmonů (SPR) a mikrokalorimetrie.  Pro pochopení molekulární podstaty interakcí budou krystalovány a řešeny struktury protein/sacharidových komplexů. Pro porozumění jednotlivých příspěvků k  afinitě  a specifitě lektinů bude používána účinná kombinace experimentálních a výpočetních metod. In silico mutageneze umožní návrhy nových lektinů s modifikovanými vazebnými vlastnostmi. Projekt má potenciální farmaceutické implikace, protože inhibitory studovaných lektinů mohou sloužit jako základ antiadhezivní terapie. Recognition of glycoconjugates is an important event in host recognition by pathogenic organisms. Project is focused on structure-function characterisation of already identified proteins from opportunistic human pathogens and also proteins that will be identified by database search in newly sequenced genomes. Selected proteins will be cloned and expressed in recombinant form. Specificities and affininties of lectins will be studied by binding experiments using Surface Plasmon Resonance and microcalorimetry methods with oligosaccharides of biological interest, such as blood group antigenic determinants.  Crystal structure determination of protein/carbohydrate complexes will be performed to understand a molecular basis of the interactions. Powerful combination of experimental and computational methods will be employed to understand crutial contributions for affinity and specificity of binding. In silico mutagenesis will help to select interesting lectin targets with modified binding properties. The present study has potential pharmaceutical implications since these inhibitors would be the basis for local anti-adhesion therapy.
dcterms:title
Lektiny z lidských patogenů - struktura, funkce, inženýrství Lectins from human pathogens - structure, function, engineering
skos:notation
GA303/09/1168
n3:aktivita
n15:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n13:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n13:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-01-30+01:00
n3:druhSouteze
n12:VS
n3:duvernostUdaju
n20:S
n3:fazeProjektu
n8:92536688
n3:hlavniObor
n17:BO
n3:hodnoceniProjektu
n6:V
n3:kategorie
n7:ZV
n3:klicovaSlova
lectin; 3D-structure; biomolecular; interactions; docking; mutagenesis
n3:partnetrHlavni
n22:orjk%3A14310
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
52
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
52
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2012-03-30+02:00
n3:prideleniPodpory
n4:303%2F09%2F1168
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n19:2012
n3:sberDatUdajeProjZameru
n19:2013
n3:soutez
n11:SGA02009GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n21:DUU
n3:typPojektu
n14:P
n3:ukonceniReseni
2012-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n17:CE
n3:zahajeniReseni
2009-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Scientific contribution of the project was structural and functional characterization of several lectins. More than 10 lectin structures have been solved. The project significantly contributed to the student training. Major outputs comprise 9 papers in scinetific journals, 1 book chapter and 40 conference contributions. No imperfections in compliance of the rules and financial spending have arisen Odborným přínosem projektu byla strukturní a funkční charakterizace některých lektinů z patogenních mikroorganismů. Bylo vyřešeno více než deset struktur lektinů. Projekt významně přispěl i k výchově studentů. Hlavními výstupy projektu je 9 publikací v mezinárodních časopisech, 1 kapitola v knize a 40 prezentací na konferencích. Nedostatky v dodržování pravidel a v čerpání financí se nevyskytly.
n3:zivotniCyklusProjektu
n18:ZBBKU
n3:klicoveSlovo
lectin biomolecular interactions 3D-structure docking