This HTML5 document contains 51 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA206%2F09%2F1405/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n7http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:GA206%2F09%2F1405
rdf:type
n19:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA206/09/1405
dcterms:description
Hlavním cílem projektu je analýza patternů genomických parametrů: (i) velikost genomu, (ii) počet chromosomů, (iii) velikost chromosomů, (iv) genomový AT/GC poměr, (v-vi) diverzita a dominance retrotransposonů u taxonů dvou kontrastních modelových rodů s holokinetickými chromosomy Carex a Eleocharis. Evoluční dynamika těchto druhově specifických genomických parametrů v rámci fylogeneze založené na molekulárních sekvenčních znacích bude využita ke zhodnocení role klíčových mechanizmů evoluce velikosti genomu: (i) polyploidie; (ii) agmatoploidie, (iii) symploidie, (iv-v) amplifikace a eliminace retrotransposonů v hlavních evolučních liniích studovaných taxonů. Modelem není  tudíž konkrétní druh jako v klasických genomických studiích, ale skupina druhů spojená sítí jejich evoluční příbuznosti. Modelové rody jsou kontrastní v (i) druhové diverzitě, (ii) evolučních centrech, (iii) ekologické diverzifikaci, ale hlavně v (iv) rozsahu velikosti chromosomů a genomů, který je u Eleocharis jeden z největších v rámci krytosemenných rodů se známou velikostí genomu a počtem chromosomů. The main goal of the project is an analysis of patterns of genomic parameters: genome size, chromosome number, chromosome size, genomic AT/GC composition, retrotransposon diversity and widespread in taxa of two contrasting model genera with holokinetic chromosomes: Carex and Eleocharis. Evolutionary dynamics of these species-specific genomic parameters in the framework of the phylogeny based on molecular sequence markers will be used for the evaluation of the role of key mechanisms in genome size evolution: (i) polyploidy; (ii) agmatoploidy, (iii) symploidy, (iv-v) retrotransposon amplification or removal in the main evolutionary lineages of taxa studied. The model is therefore not a concrete species as in classical genomic studies but the group of species connected by the net of their evolutionary relationships. The models are contrasting in (i) species diversity, (ii) evolutionary centres, (iii) ecological diversification, but mainly in (iv) variation ranges of chromosome and genome sizes, which are in Eleocharis ones of the largest known among angiosperms genera.
dcterms:title
Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
skos:notation
GA206/09/1405
n3:aktivita
n6:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n8:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n8:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2014-01-30+01:00
n3:druhSouteze
n5:VS
n3:duvernostUdaju
n13:S
n3:fazeProjektu
n11:92540707
n3:hlavniObor
n16:EF
n3:hodnoceniProjektu
n17:V
n3:kategorie
n18:ZV
n3:klicovaSlova
Genome; size; evolution; flow; cytometry; genomic; base; composition; chromosome; size; karyology; sedges; Carex; Eleocharis; polyploidy; phylogeny; retroelements
n3:partnetrHlavni
n14:orjk%3A14310
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
1
n3:pocetVysledkuRIV
14
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
14
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2012-03-30+02:00
n3:prideleniPodpory
n9:206%2F09%2F1405
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n7:2012
n3:sberDatUdajeProjZameru
n7:2013
n3:soutez
n21:SGA02009GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n10:DUU
n3:typPojektu
n4:P
n3:ukonceniReseni
2012-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2009-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Projekt popsal klíčové mechanismy v evoluci karyotypu a velikosti genomu v rodech Carex a Eleocharis, inovoval algoritmus pro tvorbu fylogenetických stromů a odhalil hlavní fylogenetické trendy odlišující evoluci holocentrických karyotypů od evoluce karyotypů monocentrických. Většina výstupů byla otištěna v renomovaných impaktovaných časopisech. The project identified key mechanisms in karyotype and genome size evolution in genera Carex and Eleocharis, improved the algorithm for inferring phylogenetic trees and revealed major phylogenetical trends distinguishing holocentric caryotypes from monocentric ones. The project yielded numerous outcomes, majority of them published in highly recognized journals.
n3:zivotniCyklusProjektu
n12:ZBBKU
n3:klicoveSlovo
Carex phylogeny composition chromosome Genome size sedges polyploidy evolution Eleocharis genomic cytometry flow base karyology