This HTML5 document contains 32 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F00%2FD012/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n7http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA204%2F00%2FD012
rdf:type
n13:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/00/D012
dcterms:description
V tomto projektu navrhujeme vytvořit software pro analýzu variací a korelací rozložení nukleotidů a oligonukleotidů v genomech. Tento software chceme aplikovat na genom Caenorhabditis elegans. Analýzy variací odliší málo informativní oligonukleotidy, jejichž rozložení se příliš neliší od rozložení v náhodných posloupnostech od těch, které jsou rozloženy nerovnoměrně. Tyto informace umožní identifikovat funkčně významné oblasti v genomech. Analýza kolerací pomůže lépe pochopit příčiny a důsledky v našlaboratoři objevené antikorelace v rozložení A a C a G a T v genomech a dále silné shlukování C s G. Také provedeme analýzu korelací rozložení dinukleotidů s cílem zjistit příčiny univerzální definice nukleotidu TA v genomech a silné závislosti variací akorelací dinukleotidu CG v genomech na tom, ze kterého organizmu pochází. Vzájemné porovnání korelací a variací v molekulách DNA šesti chromozómů tvořících genom C. elegans přispěje k pochopení jejich funkčních a evolučních souvislostí. In this project we suggest to create software for variation and correlation analysis of nucleotide and short oligonucleotide distributions in genomes. This software will be applied to the genome of Caenorhabditis elegans. The variation analysis will distinguish the less informative oligonucleotides, whose distributions are not much different from distributions in random sequences, from those oligonucleotides whose distributions are non-uniform. This information will enable identification of genomic regions with important functions. Correlation analysis will ease the understanding of the causes and consequences of A x C and G x T distribution anticorrelations, which were discovered in our laboratory, and of strong C and G clustering. We will also carry out con-elation analysis of dinucleotide distributions in order to identify the causes of universal TA dinucleotide deficiency in the genomes and strong dependence of the CG dinucleotide correlations and variations on the parent organism. Mutual co
dcterms:title
korelace a variace rozložení nukleotidů a krátkých oligonukleotidů v genomu Caenorhabditis elegans Correlations and variations of nucleotide and short oligonucleotide distributions in the genome of Caenorhabditis elegans
skos:notation
GA204/00/D012
n4:aktivita
n14:GA
n4:celkovaStatniPodpora
n12:celkovaStatniPodpora
n4:celkoveNaklady
n12:celkoveNaklady
n4:datumDodatniDoRIV
2003-04-01+02:00
n4:druhSouteze
n6:VS
n4:duvernostUdaju
n16:S
n4:fazeProjektu
n8:750872
n4:hlavniObor
n5:EB
n4:hodnoceniProjektu
n18:U
n4:klicovaSlova
Neuvedeno.
n4:partnetrHlavni
n9:ico%3A68081707
n4:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n4:pocetPrijemcu
1
n4:pocetSpoluPrijemcu
0
n4:pocetVysledkuRIV
1
n4:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
1
n4:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n7:2002
n4:sberDatUdajeProjZameru
n7:2002
n4:soutez
n15:SGA02002GA-ST
n4:statusZobrazovaneFaze
n17:DUS
n4:typPojektu
n10:P
n4:vedlejsiObor
n5:EI n5:JC
n4:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Projekt b yl předčasně ukončen na žádost řešitele (dlouhodobý zahraniční pobyt). Závěrečná karta projektu je v souladu se závěrečnou zprávou. Získané výsledky jsou adekvátní době řešení projektu (1 rok a 4 měsíce). Výstupem projektu je přiložený rukopis
n4:zivotniCyklusProjektu
n11:ZBS