This HTML5 document contains 43 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F05%2F0388/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n17http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA203%2F05%2F0388
rdf:type
n22:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/05/0388
dcterms:description
Studies of structure and dynamics of Nucleic acids (NA) and their relationship to biologiocal functions of NA represents key task of contemporary science. NA three-dimensional structure and dynamics will be investigated by advanced computational methods combined with X-ray and NMR analyses. The aim is to substantially improve the quality of structure refinement procedures, by predicting the structural and dynamical characteristics of the NA molecular fragments which are essential for reliable refinement. Biologicaly relevant structural motifs will be extracted from X-ray crystallography data and analyzed using state of the art quantum chemical and molecular dynamics calculations. Emphasis will be put on dynamics of the selected NA structural moieties (e.g., out-of-plane vibrations of the atoms involved in NA bases) by calculating their nonharmonic vibrational wave functions. The force-field utilized in the refinements will be re-parametrized accordingly. The wave functions will in turn be Studium struktury a dynamiky nukleových kyselin (NK) a jejich vztah k biologickým funkcím NK představuje klíčové téma současné vědy. Struktura a dynamika NK budou zkoumány užitím moderních výpočetních metod v kombinaci s krystalografickou a NMR analýzou.Cílem projektu je zásadním způsobem zlepšit kvalitu procedury strukturní rafinace molekulových fragmentů NK výpočtem jejich strukturních a dynamických parametrů. Biologicky relevantní strukturní motivy budou vybrány z příslušných krystalografických dat adále analyzovány užitím metod kvantové chemie a molekulové dynamiky. Důraz bude kladen na dynamické chování vybraných fragmentů strukturních motivů NK (například mimorovinný pohyb atomů bází nukleových kyselin) výpočtem příslušné neharmonické vibrační vlnové funkce. Silové pole užité pro rafinace biomolekulárních struktur bude příslušně reparamatrizováno. Vibrační vlnová funkce bude použita ke středování povrchů parametrů NMR (posun, spin-spinová štepící konstanta,CSA). Zprůměrované NMR parametry
dcterms:title
Konformační dynamika nukleových kyselin Conformational dynamics of nucleic acids
skos:notation
GA203/05/0388
n3:aktivita
n19:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n13:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n13:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2008-12-16+01:00
n3:druhSouteze
n16:VS
n3:duvernostUdaju
n15:S
n3:fazeProjektu
n10:71263236
n3:hlavniObor
n7:CF
n3:hodnoceniProjektu
n9:V
n3:kategorie
n12:ZV
n3:klicovaSlova
DNA; RNA; X-ray; NMR; force field; computer modeling
n3:partnetrHlavni
n6:ico%3A61388963
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
2
n3:pocetVysledkuRIV
30
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
30
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2007-05-02+02:00
n3:prideleniPodpory
n11:203%2F05%2F0388
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n17:2007
n3:sberDatUdajeProjZameru
n17:2008
n3:soutez
n20:SGA02005GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n14:DUU
n3:typPojektu
n18:P
n3:ukonceniReseni
2007-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n7:CE n7:BO
n3:zahajeniReseni
2005-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Rozsah teoretických metod aplikovaných při řešení zahrnující metody výpočetní kvantové chemie a molekulové dynamiky, modelování parametrů NMR spekter a strukturní X-ray databázové studie, umožnil komplexní výzkum řešené problematiky v souladu s návrhem p Applied theoretical methods including the calculation methods of quantum chemistry and molecular dynamics, the theoretical modelling of NMR spectroscopy parameters and the structural X-ray database studies allowed for complex research of the problematics
n3:zivotniCyklusProjektu
n4:ZBKU
n3:klicoveSlovo
DNA NMR X-ray RNA force field