This HTML5 document contains 36 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-15326S/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n20http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/

Statements

Subject Item
n2:GA14-15326S
rdf:type
n17:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA14-15326S
dcterms:description
Nezralá retrovirová částice vzniká oligomerizací polyproteinového prekursoru, který je po uvolnění viru z buňky štěpen na strukturní proteiny a vzniká zralá, infekční částice. Skládání nezralé virové částice je zprostředkováno vzájemnými interakcemi N-terminální (NTD) a C-terminální (CTD) podjednotky kapsidového proteinu (CA), a nukleokapsidového proteinu s nukleovou kyselinou. Návrh projektu, řešeného ve spolupráci ÚOCHB AVČR a VŠCHT Praha, je založen na dlouholeté spolupráci v oblasti skládání retrovirů a vychází z námi vyřešené 8Å struktury nezralé částice s významně odlišnými CA-CA interakcemi od zralého viru. Cílem projektu je detailní charakterizace oblastí CA, kritických pro tvorbu nezralé i zralé částice a interakcí, které je stabilizují. Pro nalezení inhibitoru skládání nezralých HIV-1 částic, využijeme racionální in silico design inhibitorů. U inhibitorů ověřených naší metodou pro testování inhibice skládání in vitro bude NMR spektroskopií stanoveno interakční rozhraní CA-inhibitor. U nejlépe vázajících se sloučenin bude stanovena cytotoxicita a vliv na infektivitu HIV. Assembly of immature retroviral particle is driven by oligomerization of polyprotein precursor, which is upon virus release, cleaved into structural proteins that rearrange into mature, infectious particle. Immature particle formation is mediated by mutual interactions of N- and C-terminal subunits (NTD and CTD, respectively) of capsid protein (CA) as well as nucleocapsid protein and nucleic acids. This proposal originates from the 8Å structure of immature particle with substantially distinct CA-CA interactions from those in mature virion. We will characterize in detail CA regions critical for formation of immature and mature particles and interactions participating in their stabilization. We will use rational in silico inhibitor design to search for the assembly inhibitors. The activity of selected inhibitors will be evaluated using our assay kit. The CA interaction interfaces with inhibitors will be determined using NMR spectroscopy. The best inhibitors will be tested for their cytotoxicity and effect on HIV-1 infectivity.
dcterms:title
Study of structure and interactions critical for formation of immature retroviral particles for testing and rational design of HIV assembly inhibitors Studium struktury a klíčových interakcí vedoucích k tvorbě nezralých retrovirových částic pro testování a racionální návrh inhibitorů skládání HIV.
skos:notation
GA14-15326S
n3:aktivita
n4:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n12:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n12:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n3:druhSouteze
n9:VS
n3:duvernostUdaju
n15:S
n3:fazeProjektu
n5:100793292
n3:hlavniObor
n11:EE
n3:kategorie
n18:ZV
n3:klicovaSlova
retrovirus, HIV, assembly, capsid protein
n3:partnetrHlavni
n21:ico%3A61388963
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
1
n3:pocetVysledkuRIV
2
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
2
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-03-31+02:00
n3:prideleniPodpory
n14:14-15326S
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n20:2015
n3:sberDatUdajeProjZameru
n20:2015
n3:soutez
n16:SGA0201400001
n3:statusZobrazovaneFaze
n8:DRRVB
n3:typPojektu
n19:P
n3:ukonceniReseni
2016-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2014-01-01+01:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n6:ZB
n3:klicoveSlovo
assembly retrovirus HIV