This HTML5 document contains 47 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-09979S/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n8http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA14-09979S
rdf:type
n21:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA14-09979S
dcterms:description
RNA polymerase II (RNAPII) directs transcription of protein-coding genes. It contains a C-terminal domain (CTD) with repeats of heptapeptide YSPTSPS where individual serines (Ser) get phosphorylated. The phosphorylation status of the CTD regulates transcription cycle and other cellular functions. Our study implicated the CTD to have a role in transcription-coupled genome instability. We identified Cyclin K-associated kinases Cdk12 and Cdk13 and found out that Cdk12 phosphorylates Ser2 in the CTD and regulates expression of DNA damage response (DDR) genes including BRCA1, FANCI and ATR. Consistently, Cdk12 is deregulated in tumors. However, the mechanism that directs expression of the Cdk12-dependent DDR genes is unknown; likewise the cellular function of Cdk13 is enigmatic. This proposal aims to: 1) identify Cdk12 and Cdk13 protein complexes, 2) investigate the role of Cdk12-dependent transcriptional elongation and mRNA processing in the expression of DDR genes and 3) clarify the role of the Ser2 kinase activity of Cdk12 in the expression of DDR genes and in the onset of cancer. RNA polymeráza II (RNAPII) řídí transkripci protein kódujících genů. Obsahuje C-terminální doménu (CTD) s repeticí heptapeptidu YSPTSPS, kde jsou jednotlivé seriny (Ser) fosforylovány. Fosforylační status CTD reguluje transkripční cyklus a další bunečné procesy. Náš výzkum vedl k objevu role CTD v transkripčně regulovaném procesu genomové nestability. Identifikovali jsme Cyklin K-asociované kinázy Cdk12 and Cdk13 a dále jsme zjistili, že Cdk12 fosforyluje Ser2 v CTD a že reguluje expresi významných “DNA damage response” (DDR) genů, včetně BRCA1, FANCI a ATR. V souladu s tímto zjištením je deregulace proteinu Cdk12 v různých nádorech. Nicméné, mechanismus, který, řídí expresi Cdk12 závislých DDR genů je nejasný; podobně funkce Cdk13 v bunce není známá. Návrh tohoto grantu má za cíl: 1) identifikaci proteinových komplexů Cdk12 a Cdk13, 2) zjistění role Cdk12 regulované transkripční elongace a mRNA procesování na expresi DDR genu a 3) objasnění funkce Ser2 kinázové activity Cdk12 pri expresi DDR genů a při vzniku rakoviny.
dcterms:title
The role of Cdk12 and C-terminal domain of RNA polymerase II in transcription-coupled genome instability Role Cdk12 a C-terminální domény RNA polymerázy II v transkripcně regulovaném procesu genomové nestability
skos:notation
GA14-09979S
n4:aktivita
n16:GA
n4:celkovaStatniPodpora
n5:celkovaStatniPodpora
n4:celkoveNaklady
n5:celkoveNaklady
n4:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n4:druhSouteze
n7:VS
n4:duvernostUdaju
n13:S
n4:fazeProjektu
n6:100791687
n4:hlavniObor
n19:EB
n4:kategorie
n17:ZV
n4:klicovaSlova
Cdk12, Cdk13, Cyclin K, Cdk9, P-TEFb, transcription, C-terminal domain of RNA polymerase II, phosphorylation of Ser2 in the C-terminal domain of RNA polymerase II, transcriptional elogation, BRCA1, FANCI, DNA damage response, genome stability, cancer, o…
n4:partnetrHlavni
n18:orjk%3A14740
n4:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n4:pocetPrijemcu
1
n4:pocetSpoluPrijemcu
0
n4:pocetVysledkuRIV
2
n4:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
2
n4:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-03-14+01:00
n4:prideleniPodpory
n9:14-09979S
n4:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n8:2015
n4:sberDatUdajeProjZameru
n8:2015
n4:soutez
n11:SGA0201400001
n4:statusZobrazovaneFaze
n14:DRRVB
n4:typPojektu
n10:P
n4:ukonceniReseni
2016-12-31+01:00
n4:zahajeniReseni
2014-01-01+01:00
n4:zivotniCyklusProjektu
n12:ZB
n4:klicoveSlovo
Cdk9 BRCA1 cancer DNA damage response P-TEFb transcription FANCI Cdk12 genome stability Cyclin K C-terminal domain of RNA polymerase II Cdk13 phosphorylation of Ser2 in the C-terminal domain of RNA polymerase II transcriptional elogation