This HTML5 document contains 40 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n20http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-08651S/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n9http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA13-08651S
rdf:type
n6:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-08651S
dcterms:description
Projekt je zaměřen na počítačové modelování interakcí organických molekul (přírodních organických hmot, polycyklických aromatických uhlovodíků), biomolekul (stavebních bloků DNA) a směsí rozpouštědel s minerálními povrchy s důrazem na ekologicky a technologicky důležité systémy. Interakce těchto molekul s povrchy tvořenými křemenem a rutilem budou studovány pomocí molekulární mechaniky, molekulární dynamiky a ab initio výpočetními metodami pro různé povrchové hustoty náboje povrchů, které odpovídají rozmezí hodnot pH za podmínek experimentu či v přírodních procesech. Ze simulací budou získány struktury adsorbovaných komplexů, termodynamické vlastnosti, tj. interakční energie, volné energie a adsorpční izotermy vzniklých komplexů a dále budou identifikovány nejvýznamnější typy interakcí v komplexech a vliv jednotlivých atomů a funkčních skupin na jejich stabilitu. Výsledky našich simulací budou porovnány s experimentálními daty, a to jak se stávajícími, tak s výsledky probíhajícího výzkumu našich spolupracovníků zabývajících se experimenty. The project is focused on computer modeling of interactions of organic molecules (natural organic matter, polycyclic aromatic hydrocarbons), biomolecules (DNA building blocks) and binary mixtures of solvents with mineral surfaces applied on environmentally and technologically important systems. Interactions of these molecules with quartz and rutile surfaces will be studied for a set of surface charge densities corresponding to the experimentally or naturally relevant ranges of pH values employing molecular mechanics, molecular dynamics and ab initio techniques. The simulation outputs will provide conformations of the adsorption complexes, thermodynamic properties, i.e. interaction energies, free energies and adsorption isotherms. Leading interactions and roles of participating atoms and groups will be identified in the complexes. Our simulation results will be linked with experimental results, both using existing experimental data as well as carrying out simulations related to ongoing experimental research of our partners.
dcterms:title
Computational study of interactions of organic matter and biomolecules with mineral surfaces Počítačové modelování interakcí organické hmoty a biomolekul s minerálními povrchy
skos:notation
GA13-08651S
n3:aktivita
n11:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n19:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n19:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n3:druhSouteze
n14:VS
n3:duvernostUdaju
n16:S
n3:fazeProjektu
n8:100769931
n3:hlavniObor
n12:CF
n3:kategorie
n15:ZV
n3:klicovaSlova
natural organic matter, biomolecules, amino acids, quartz, rutile, simulation, molecular dynamics, ab initio calculations
n3:partnetrHlavni
n20:orjk%3A12310
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
4
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
4
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-03-31+02:00
n3:prideleniPodpory
n10:13-08651S
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n9:2015
n3:sberDatUdajeProjZameru
n9:2015
n3:soutez
n4:SGA0201300005
n3:statusZobrazovaneFaze
n18:DRRVB
n3:typPojektu
n13:P
n3:ukonceniReseni
2016-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2013-02-01+01:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n17:ZBB
n3:klicoveSlovo
natural organic matter quartz simulation molecular dynamics biomolecules amino acids rutile