This HTML5 document contains 42 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA102%2F08%2F0691/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/hodnoceniProjektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n21http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n11http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA102%2F08%2F0691
rdf:type
n4:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA102/08/0691
dcterms:description
Cílem projektu je vývoj metodiky pro objemovou rekonstrukci, segmentaci a stereologická měření obrazů získaných laserovým konfokálním mikroskopem z velkých biologických vzorků s využitím trojrozměrného (3D) zobrazování, virtuální reality a programování grafické procesorové jednotky (GPU). Vyvineme programové vybavení realizující objemovou rekonstrukci s ohledem na specifika konfokálních obrazů a daných biologických materiálů: Zaměříme se na zlepšení vizuální kvality obrazů v sériích, horizontální skládání zorných polí a vertikální skládání obrazů následných fyzických řezů ve výslednou digitální reprezentaci preparátu. Navrhneme metodu elastické registrace pro skládání objemů následných fyzických řezů. Vyvineme nové metody interaktivních 3D segmentačních algoritmů, těžících z možnosti zobrazování, jak pomocí objemového renderování, tak pomocí scény ve virtuální realitě. Algoritmy budou založeny na využití tenzorových obrazů s odpovídající úpravou metod 3D-live-wire a graph-cuts. Vyvineme The aim of the project is to develop a methodology for volume reconstruction, segmentation and stereological measurements of images captured by a confocal laser-scanning microscope from large biological tissue specimens using three-dimensional (3D) imaging, virtual reality and graphics processor unit (GPU) programming. We will develop a software system performing volume reconstruction taking into account specific features of captured data sets, which includes improvement of visual quality of images, merging images of horizontal fields of view and vertical merging of images of subsequent physical slices into a digital volume representation of the whole specimen. We will implement an elastic registration method for merging images of the subsequent physical slices. We will develop new algorithms for 3D segmentation taking advantages of visualization using real-time volume rendering and virtual reality. The algorithms will utilize image tensors with adequate modification of 3D-live-wire
dcterms:title
Visualization and processing of 3D images captured by a confocal microscope using graphics processor unit programming and virtual reality Vizualizace a zpracování 3D obrazových dat z konfokálního mikroskopu s využitím programování grafické procesorové jednotky a virtuální reality
skos:notation
GA102/08/0691
n3:aktivita
n14:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n17:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n17:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-02-09+01:00
n3:druhSouteze
n19:VS
n3:duvernostUdaju
n6:S
n3:fazeProjektu
n15:82297739
n3:hlavniObor
n12:JC
n3:hodnoceniProjektu
n22:U
n3:kategorie
n21:ZV
n3:klicovaSlova
confocal microscopy; volume reconstruction; elastic registration; 3D segmentation; stereology; virtu
n3:partnetrHlavni
n16:ico%3A67985823
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
27
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
27
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2010-04-16+02:00
n3:prideleniPodpory
n7:102%2F08%2F0691
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n11:2010
n3:sberDatUdajeProjZameru
n11:2011
n3:soutez
n9:SGA02008GA-ST
n3:statusZobrazovaneFaze
n5:DUU
n3:typPojektu
n10:P
n3:ukonceniReseni
2010-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n12:JD
n3:zahajeniReseni
2008-01-01+01:00
n3:zhodnoceni+vysledku+projektu+dodavatelem
Během projektu byla vyvinuta a publikována originální metodika pro objemovou rekonstrukci velkých biologických vzorků z konfokálních dat korigující nežádoucí deformace obrazů. Tato metodika byla rozšířena o využití moderní mikroskopické metody OPT (Optical Projection Tomography Microscopy). Bylo realizováno šest časově náročných objemových rekonstrukcí z myších embryí. Implementovali jsme uživate During the project we developed and published an original methodology for volume reconstruction from the confocal data of large biological specimens with correction of undesirable image distortions. This methodology was further extended by using a modern microscopic method - OPT (Optical Projection Tomography Microscopy). We performed six time-consuming volume reconstructions from mouse embryos.
n3:zivotniCyklusProjektu
n20:ZBKU
n3:klicoveSlovo
3D segmentation stereology volume reconstruction confocal microscopy elastic registration