This HTML5 document contains 26 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/523/09/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/GA0/GA523/09/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#

Statements

Subject Item
n2:1972
rdf:type
n3:Projekt
dcterms:description
Comparative analysis of the immunogenome of the family Equidae in the context of host-pathogen interactions will be performed. Allelic sequence diversity, evolution and balancing selection of the MHC DRB, DQB genes and of the KIR/Ly49 genes, encoding natural killer cell receptors will be analyzed in zebras, asses and donkeys. Furthermore, comparative analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in selected immunity-related genes will be performed in various species of zebras, asses and in two populations of domestic donkeys. Genes showing across-breed associations with virus (West Nile virus), bacterial (Rhodococcus equi) and protozoan (Trypanosoma evansi) infections will be selected for analysis. Horse-specific primers will be used for amplifying the corresponding orthologues in other equid species. The PCR products will be cloned and sequenced. SNPs identified will be used for evaluating the extent of genetic diversity and evolutionary relationships of various Equids. Chromosome evolution of Equidae with special focus on chromosome microrearrangements will be investigated. Cílem projektu je srovnávací analýza imunogenomu čeledi Equidae v kontextu interakcí hostitele a patogena. Na základě určení sekvenční alelické diversity genů MHC DRB a DQB a dvou rodin genů kódujících receptory NK buněk KIR/Ly49 bude provedena evoluční analýza u různých druhů zeber, velkých oslů a domácích oslů z Itálie a Keni, dále bude zkoumán vliv balancované selekce na specifická aminokyselinová místa. Polymorfismus genů imunitní odpovědi, které jsou nejméně u dvou plemen koní asociovány s resistencí k virové (virus západonilské horečky), bakteriální (Rhodococcus equi) a protozoární (Trypanosoma evansi) infekci bude analyzován za využití koňských primerů u různých příslušníků čeledi Equidae. PCR produkty budou klonovány, sekvenovány a budou v nich identifikovány jednonukleotidové polymorfismy (SNP). Data budou využita pro určení stupně genetické diversity  různých populací a pro určení evolučních vztahů mezi druhy. Evoluce chromosomů se zvláštním zřetelem na mikropřestavby při speciaci bude zkoumána za využití metod molekulární cytogenetiky.
dcterms:title
Komparativní imunogenomika čeledi Equidae Comparative immunogenomics of the family Equidae
n3:cislo-smlouvy
n8:1972
n3:dalsi-vedlejsi-obor
n9:EB
n3:druh-souteze
n7:VS
n3:faze
n12:54480425
n3:hlavni-obor
n9:GI
n3:vedlejsi-obor
n9:GJ
n3:id-aktivity
n11:GA
n3:id-souteze
n5:SGA02009GA-ST
n3:kategorie
n13:1
n3:klicova-slova
Immunity-related; genes; MHC; KIR/Ly49; SNP; FISH; horse; Equids; evolution
n3:konec-reseni
2012-12-31+01:00
n3:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n3:poskytovatel
n10:GA0
n3:start-reseni
2009-01-01+01:00
n3:statni-podpora
6886
n3:typProjektu
n6:P
n3:uznane-naklady
6886
n3:pocet-prijemcu
1
n3:pocet-spoluprijemcu
2
n3:pocet-vysledku
6
n3:pocet-vysledku-zverejnovanych
6