This HTML5 document contains 24 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

Prefix	IRI
n6	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
n5	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
dcterms	http://purl.org/dc/terms/
n12	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n8	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n10	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n7	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdf	http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n13	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n4	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdh	http://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/
n9	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/

Statements

Subject Item

n2:KJB400500602

rdf:type

n3:Projekt

dcterms:description

Nepřirozené báze zabudované do molekul DNA tvoří základ rozšířené genetické abecedy, jež otvírá cestu k mnohým biotechnologickým aplikacím. Pomocí metod teoretické chemie prostudujeme roli různých strukturních a vnějších efektů rozhodujících pro stabilizaci dvoušroubovic DNA obsahujících nepřirozené báze a pro selektivitu vazebných schémat, jež se v nich vyskytují. Vypracujeme vysoce spolehlivé výpočetní postupy pro popis jak vnitřních, tak vnějších vlivů vedoucích k tvorbě stabilních a selektivních strukturních motivů obsahujících nepřirozené báze; tyto postupy upotřebíme během rozsáhlých výpočtů. Vnitřní vlivy budou studovány ab initio kvantově chemickými metodami, kdežto vliv okolí bude popsán pomocí klasické molekulové dynamiky s explicitním zahrnutím molekul rozpouštědla a protiiontů. Na základě vypočtených dat bude vyvinuta teorie s významnou predikční schopností, jež společně popisuje tyto vlivy a tím umožňuje kvantifikovat stabilitu a selektivitu neobvyklých fragmentů v DNA. Unnatural nucleobases incorporated into DNA molecules are the basis of the expanded genetic alphabet, which opens the way to a variety of biotechnology applications. Using the methods of theoretical chemistry, we will study the role various structural and environmental effects play in the stabilization of oligonucleotide duplexes containing unnatural nucleobases and in the selectivity of the respective pairing schemes. We will elaborate and apply highly reliable computational protocols for the description of both the intrinsic and external influences leading to the formation of stable and selective unnatural nucleobase-containing motifs. The intrinsic and external factors will be characterized by ab initio quantum chemical methods and classical molecular dynamics, respectively. Based on computational data, the theory of significant prediction value will be developed which combines these contributions and thus enables to quantify the stability and selectivity of novel DNA skeletons.

dcterms:title

Teorie stability a selektivity nepřirozených bází DNA The Theory of Stability and Selectivity of Unnatural DNA Nucleobases

n3:cislo-smlouvy

n9:KJB400500602

n3:druh-souteze

n10:VS

n3:faze

n7:36440551

n3:hlavni-obor

n8:CD

n3:id-aktivity

n12:KJ

n3:id-souteze

n6:SAV02006-B

n3:kategorie

n5:1

n3:klicova-slova

DNA; unnatural nucleobases; stability; selectivity; nonbonding interactions; ab initio quantum chemical methods; molecular dynamics; hydrophobic effect

n3:konec-reseni

2008-12-31+01:00

n3:pocet-koordinujicich-prijemcu

0

n3:poskytovatel

n4:AV0

n3:start-reseni

2006-01-01+01:00

n3:statni-podpora

1175

n3:typProjektu

n13:P

n3:uznane-naklady

1175

n3:pocet-prijemcu

1

n3:pocet-spoluprijemcu

0

n3:pocet-vysledku

4

n3:pocet-vysledku-zverejnovanych

4