This HTML5 document contains 26 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/

Statements

Subject Item
n2:KJB400040901
rdf:type
n3:Projekt
dcterms:description
The project is focused on study of ribosomal RNA multiple junctions complex molecules composed of RNA motifs/submotifs. These systems consist of non-standard pairs and have specific structure dynamical properties that assert in synthesis of proteins. The proposal is aimed at description of these systems using modern molecular dynamics methods and bioinformatics, and determination of their functional roles. Structural dynamics, basepairing, specific hydration and ion binding and also molecular interactions of selected systems will be characterized on nanoseconds time scales. Computations will be complemented by sequence analysis. Based on obtained results and current experimental data functional roles of selected junctions in proteosynthesis will be suggested. Characterization of ribosomal RNA motifs/submotifs represents a significant task because these structures do not occur only in the ribosome but also in other RNA molecules where they assert in key processes. Projekt se zaměřuje na studium ribozomálních RNA multiple junction, což jsou komplexní molekuly složené z RNA motivů/submotivů. Tyto systémy jsou tvořeny ne-standardními páry bází a mají specifické strukturně dynamické vlastnosti, které se uplatňují při syntéze proteinů. Navrhovaný projekt si klade za cíl popsat tyto systémy pomocí molekulově dynamických metod a bioinformatiky a určit jejich funkční role. U vybraných systémů bude na nanosekundových časových škálách charakterizována strukturní dynamika, párování bází, specifická hydratace a vazba iontů, a také molekulové interakce. Studie budou doplněny sekvenčními analýzami. Na základě získaných výsledků a současných experimentálních dat budou navrženy funkční role vybraných RNA junction v procesu syntézy proteinů. Charakterizace ribozomálních RNA motivů/submotivů představuje důležitou úlohu neboť tyto struktury se kromě ribozomu vyskytují také v dalších molekulách RNA kde se uplatňují při klíčových procesů.
dcterms:title
Počítačová studie RNA multiple junction lokalizovaných ve funkčně významných místech ribozomu Computational study of RNA multiple junctions localized in functionally important sites of the ribosome
n3:cislo-smlouvy
n4:KJB400040901
n3:dalsi-vedlejsi-obor
n6:EB
n3:druh-souteze
n13:VS
n3:faze
n9:54154861
n3:hlavni-obor
n6:CE
n3:vedlejsi-obor
n6:BO
n3:id-aktivity
n12:KJ
n3:id-souteze
n8:SAV02009-B
n3:kategorie
n10:1
n3:klicova-slova
computational modeling; ribonucleic acids; ribosome; base pairs; molecular dynamics; bioinformatics
n3:konec-reseni
2011-12-31+01:00
n3:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n3:poskytovatel
n11:AV0
n3:start-reseni
2009-01-01+01:00
n3:statni-podpora
717
n3:typProjektu
n7:P
n3:uznane-naklady
717
n3:pocet-prijemcu
1
n3:pocet-spoluprijemcu
0
n3:pocet-vysledku
10
n3:pocet-vysledku-zverejnovanych
10