This HTML5 document contains 22 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/

Statements

Subject Item
n2:IAB1048901
rdf:type
n3:Projekt
dcterms:description
Projekt je zaměřen na teoretické modelování účinku ionizujícího záření (IZ) na komplexy DNA s různými ligandy (interkalátory, ligandy v malé a velké rýze). Navrhovaný přístup využívá dříve vytvořený teoretický model, který simuluje účinek volných radikálů vzniklých radiolýzou prostředí obklopujícího studovanou DNA. Model je založen na simulační metodě Monte Carlo (simulace vzniku a difuse radikálů) a teorii Smoluchowského (chemické reakce radikálů s DNA a ligandy). Třídimensionální atomické struktury komplexů DNA-ligand používané v simulacích budou získány buďto z databank (PDB, NDB) a nebo budou určeny molekulárním modelováním pomocí minimalizace energie studovaných komplexů (program SYBYL). Pravděpodobnosti reakcí radikálů s reačními místy DNA a ligandů budou porovnávány s parametry struktury komplexů a dostupnými experimentálními daty. Výsledky budou analyzovány s ohledem na výtěžky a závažnost poškození DNA způsobených IZ. The project includes simulation of radiation attack on DNA complexes with ligands interacting by intercalation, minor or major groove binding. The suggested approach applies an original theoretical model which takes into account the effects of free radicals produced by the radioation in DNA surrounding. Our recently developed model is based on Monte Carlo simulation method (simulation of origin and diffusion of radicals) and Smoluchowski theory (chemical reactions of radicals with ligands and DNA).The three-dimensional atomic structures of DNA-ligand complexed used in simulations will be obtained from structure databanks (PDB, NDB) or will be calculated by the energy minimization of studied complexes (software SYBYL). Probabilities of radical attack to the reaction sites of DNA and ligands will be calculated and compared to the structural parameters of complexes. The results will be analyzed in relation to radiation induced DNA damages.
dcterms:title
Vliv ligandů na radiačně indukovaná poškození DNA Effects of drugs on radiation induced damages of DNA
n3:dalsi-vedlejsi-obor
n7:EB
n3:druh-souteze
n8:
n3:faze
n4:20064234
n3:hlavni-obor
n7:BO
n3:vedlejsi-obor
n7:CE
n3:id-aktivity
n11:IA
n3:id-souteze
n6:
n3:kategorie
n12:0
n3:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n3:poskytovatel
n5:AV0
n3:statni-podpora
226
n3:typProjektu
n9:P
n3:uznane-naklady
282
n3:pocet-prijemcu
1
n3:pocet-spoluprijemcu
0
n3:pocet-vysledku
6
n3:pocet-vysledku-zverejnovanych
6