This HTML5 document contains 26 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/

Statements

Subject Item
n2:IAA601410708
rdf:type
n4:Projekt
dcterms:description
Projekt studuje vnitrogenomovou variabilitu 16S rDNA u symbiotických bakterií a její vliv na rekonstrukci fylogenetických a koevolučních vztahů. V předchozích studiích jsme zjistili, že odlišné kopie 16S rDNA z genomu symbionta triatom, Arsenophonus triatominarum, poskytují navzájem neslučitelné fylogeneze. Společně se značným posunem v nukleotidovém složení genů ukazuje toto zjištění, že vztah mezi A. triatominarum a hostitelem je zřejmě staršího data, než by vyplývalo z inkongruence jejich fylogenezí. Předpokládáme, že tento jev se vztahuje i na další symbiotické bakterie a měl by být zohledněn v koevolučních studiích. V rámci projektu bude mapováno množství a celková variabilita kopií 16S rDNA v různých liniích rodu Arsenophonus. Pro doplnění souboru dat, bude provedeno vyhledávání dalších linií v různých skupinách hmyzu. Jako doplňujícího kritéria pro posouzení relativního stáří symbiotických vztahů bude použita míra posunu v nukleotidovém složení a výpočet divergenčních časů. The project investigates 16S rDNA intragenomic heterogeneity in symbiotic bacteria and its influence on reconstruction of coevolutionary relationships. Our previous research showed that in Arsenophonus triatominarum, symbiont of triatomines, different copies of 16S rDNA provide conflicting phylogenies. This finding, together with high degree of compositional bias, suggests that A. triatominarum may have been associated with its host for considerably longer time than indicated by their incongruent phylogenies. We suggest that this phenomenon applies to other secondary symbionts and should be taken into account when inferring the coevolution. In the project, we map number and heterogeneity of 16S rDNA copies in lineages of Arsenophonus bacteria. To obtain more complex picture, we will screen for additional Arsenophonus lineages in insects. We use the degree of composition bias and the calculation of divergence times as subsidiary source of information on relative age of the associations.
dcterms:title
Vliv vnitrogenomové variability rDNA na koevoluční analýzu ve vztahu hmyz-symbiont An effect of rDNA intragenomic variability on coevolutionary analysis in insect-symbiont associations
n4:cislo-smlouvy
n5:IAA601410708
n4:dalsi-vedlejsi-obor
n6:EB
n4:druh-souteze
n11:VS
n4:faze
n9:36942098
n4:hlavni-obor
n6:EG
n4:vedlejsi-obor
n6:EE
n4:id-aktivity
n13:IA
n4:id-souteze
n12:SAV02007-A
n4:kategorie
n7:1
n4:klicova-slova
coevolution, symbiosis, molecular phylogenetics
n4:konec-reseni
2009-12-31+01:00
n4:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n4:poskytovatel
n10:AV0
n4:start-reseni
2007-01-01+01:00
n4:statni-podpora
2129
n4:typProjektu
n8:P
n4:uznane-naklady
2129
n4:pocet-prijemcu
1
n4:pocet-spoluprijemcu
0
n4:pocet-vysledku
3
n4:pocet-vysledku-zverejnovanych
3