This HTML5 document contains 26 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/

Statements

Subject Item
n2:IAA600200519
rdf:type
n3:Projekt
dcterms:description
Diversity of secondary metabolism genes in actinomycetes will be assessed together with 16S rDNA genes diversity in environmental DNA of soils from extremely diverse habitats. Soil samples will be also subjected to the isolation of bacteria. Directed selection of isolates will establish a diversified collection of soil actinomycetes. In the obtained collection of species and strains, diversity of selected secondary metabolic genes coding for common enzymes, e.g. polyketide synthases, or rare ones, e.g. halogenases, will be determined. Phylogenetic trees constructed from sequences of the enzymes typical of secondary metabolism will be compared to those based on the 16S rDNA genes. Presence of the rare genes in the isolates will be correlated to the level of homology in the more common genes. Variability of the rare genes will be studied in relationship to the diversity of sampled habitats but also in relationship to preservation of their original function in the biosynthetic cluster. Diverzita genů sekundárního metabolismu společně s diversitou 16S rDNA genů u aktinomycet bude stanovena z půdní DNA odebrané na extrémních stanovištích. Vybrané vzorky půdy budou použity i k izolaci bakterií a vytvoření sbírky zaměřené na neobvyklé a obtížně kultivovatelné skupiny aktinomycet. U souboru sbírkových kmenů bude určována rozmanitost genů kódujících rozšířené enzymy sekundárního metabolismu, např. syntázy polyketidových antibiotik, ale i rozmanitost genů pro vzácně se vyskytující enzymy, např. halogenázy. Evoluční stromy sestavené z těchto enzymů budou porovnávány s fylogenetickými stromy získanými ze sekvencí 16S rDNA. Přítomnost vzácných genů u izolovaných kmenů bude sledována spolu s úrovní homologie u běžnějších genů. Konzervovanost sekvencí vzácných genů bude vztažena k diversitě odběrových míst, ale i k zachování jejich původní funkce v biosyntetickém klastru.
dcterms:title
Evoluce sekundárního metabolismu u aktinomycet: průzkum a využití genetické variability Evolution of secondary metabolism in actinomycetes: exploitation of genetic variability
n3:cislo-smlouvy
n11:IAA600200519
n3:dalsi-vedlejsi-obor
n9:EB
n3:druh-souteze
n7:VS
n3:faze
n10:36945359
n3:hlavni-obor
n9:EE
n3:vedlejsi-obor
n9:EH
n3:id-aktivity
n4:IA
n3:id-souteze
n13:SAV02005-A
n3:kategorie
n5:1
n3:klicova-slova
secondary metabolism; antibiotics; Actinomycetales; soil
n3:konec-reseni
2009-12-31+01:00
n3:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n3:poskytovatel
n12:AV0
n3:start-reseni
2005-01-01+01:00
n3:statni-podpora
3127
n3:typProjektu
n8:P
n3:uznane-naklady
3127
n3:pocet-prijemcu
1
n3:pocet-spoluprijemcu
0
n3:pocet-vysledku
4
n3:pocet-vysledku-zverejnovanych
4