This HTML5 document contains 24 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/

Statements

Subject Item
n2:IAA500960705
rdf:type
n4:Projekt
dcterms:description
RNA metabolismus trypanosom má řadu jedinečných vlastností, například editování RNA pomocí inzercí a delecí U. Naše znalosti o mechanismu editování jsou poměrně detailní, zatímco proteiny, které nejsou součástí editosomu, ale podílejí se na editování či stabilitě mt RNA, jsou přehlížené. V současnosti jsme vyřešením krystalické struktury ukázali, že komplex proteinů MRP má schopnost spojovat dvě molekuly RNA. Předběžné údaje naznačují funkci proteinu TbRGG1 a REAP1 nejen při editování, ale rovněž i procesování RNA. Naším cílem je studium funkce těchto genů u Trypanosoma brucei za použití následujících přístupů: i/ vypnout vybrané geny pomocí RNA interference s cílem zjistit jejich funkci při editování a modifikacích RNA; ii/ vnést označené přirozené a mutované verze těchto genů s cílem identifikovat vazebné partnery a studovat jejich vlastnosti; iii/ over-exprimovat tyto a nově identifikované proteiny pro jejich použití in vitro v RNA-vazebných esejích a ve strukturálních studiích. The RNA metabolism of trypanosomatids has many unusual aspects, e.g U-insertion/deletion RNA editing. Much research has focused on the core RNA editing machinery, while other accessory factors, proteins implicated in this process, are in various stages of understanding. We have recently shown, also by solving its crystal structure, that the MRP protein complex has a multifarious role in RNA metabolism. Preliminary data suggest a role in RNA editing and perhaps in other RNA processing for TbRGG1 and REAP1. We propose to further the understanding of these genes via the functional genetic tools available in Trypanosoma brucei to i/ silence specific genes to determine an effect on RNA editing or other RNA processing events; ii/ knock-in tagged wild-type or mutant versions of these genes to find protein partners and determine features that facilitate this binding; iii/ over-express the above and newly discovered proteins for in vitro RNA binding assays and structural studies.
dcterms:title
Úloha RNA vazebných proteinů podílejících se na úpravách mitochondriálních transkriptů u Trypanosoma brucei The role of Trypanosoma brucei RNA binding proteins in mitochondrial transcript processing.
n4:cislo-smlouvy
n5:IAA500960705
n4:druh-souteze
n13:VS
n4:faze
n11:53114040
n4:hlavni-obor
n7:EB
n4:id-aktivity
n9:IA
n4:id-souteze
n12:SAV02007-A
n4:kategorie
n8:1
n4:klicova-slova
trypanosoma; RNA editing; RNA interference; functional analysis; TbRGG1; REAP1
n4:konec-reseni
2010-12-31+01:00
n4:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n4:poskytovatel
n6:AV0
n4:start-reseni
2007-01-01+01:00
n4:statni-podpora
4911
n4:typProjektu
n10:P
n4:uznane-naklady
4911
n4:pocet-prijemcu
1
n4:pocet-spoluprijemcu
0
n4:pocet-vysledku
9
n4:pocet-vysledku-zverejnovanych
9