This HTML5 document contains 26 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/

Statements

Subject Item
n2:IAA500040903
rdf:type
n3:Projekt
dcterms:description
We will perform a bioinformatic analysis of the human, chimp and other genomes to identify and localize the longest blocks with an extremely high content of adenine and guanine in one strand of DNA. We will compare results obtained with various genomes to understand function of the blocks. Using NMR spectroscopy, we will determine a detailed molecular structure (GA)n and (GAA)n. Using CD spectroscopy and gel electrophoresis we will compare secondary structures of fragments related to (GA)n and (GAA)n. Using PCR we will assess their inclination to expansion that relates to genome evolution and its pathological changes. We will develop photochemical methods to find secondary structure of the fragments in genomic content. Empirical analysis of the crystal structures of DNA will serve to find the role of vertical interactions of bases and their hydrogen bonding. The project shall contribute to a better understanding of the role the very long(G+A) fragments play in the genomes. Provedeme bioinformatickou analýzu lidského, šimpanzího a dalších genomů s cílem identifikovat a lokalizovat nejdelší úseky s extrémně vysokým obsahem guaninu a adeninu v jednom řetězci DNA. Výsledky pro jednotlivé genomy porovnáme pro pochopení jejich funkce. Pomocí NMR spektroskopie určíme detailní molekulární strukturu (GA)n a (GAA)n.Pomocí CD spektroskopie a gelové elektroforézy porovnáme sekundární strukturu vybraných fragmentů příbuzných (GA)n a (GAA)n. Pomocí PCR určíme jejich náchylnost k prodlužování, které má vztah k evoluci genomů a jejich patologickým změnám. Vyvineme fotochemické metody pro stanovení sekundární struktury fragmentů (G+A) v genomovém kontextu. Empirická analýza krystalových struktur DNA bude sloužit k nalezení zákonitostí vertikálního vrstvení a vodíkového párování fragmentů (G+A). Projekt přispěje k pochopení úlohy, kterou v genomech hrají velmi dlouhé úseky s extrémním obsahem guaninu a adeninu v jednom řetězci DNA.
dcterms:title
Biofyzika a bioinformatika genomových fragmentů DNA velice bohatých na guanin a adenin Biophysics and bioinformatics of genomic DNA fragments very rich in guanine and adenine
n3:cislo-smlouvy
n4:IAA500040903
n3:dalsi-vedlejsi-obor
n8:EB
n3:druh-souteze
n9:VS
n3:faze
n6:54715670
n3:hlavni-obor
n8:BO
n3:vedlejsi-obor
n8:CE
n3:id-aktivity
n10:IA
n3:id-souteze
n11:SAV02009-A
n3:kategorie
n5:1
n3:klicova-slova
DNA; primary structure; secondary structure; genomes; biophysics; bioinformatics; CD spectroscopy; NMR spectroscopy; gel electrophoresis; PCR; photochemistry; UV spectroscopy; crystal structures
n3:konec-reseni
2013-12-31+01:00
n3:pocet-koordinujicich-prijemcu
1
n3:poskytovatel
n12:AV0
n3:start-reseni
2009-01-01+01:00
n3:statni-podpora
4659
n3:typProjektu
n13:P
n3:uznane-naklady
4659
n3:pocet-prijemcu
2
n3:pocet-spoluprijemcu
0
n3:pocet-vysledku
7
n3:pocet-vysledku-zverejnovanych
7