This HTML5 document contains 22 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

Prefix	IRI
n12	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
n10	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
dcterms	http://purl.org/dc/terms/
n9	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n3	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n4	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n6	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n8	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdf	http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n7	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n11	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdh	http://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/

Statements

Subject Item

n2:IAA4004701

rdf:type

n3:Projekt

dcterms:description

By CD spectroscopy and PAGE we propose to study the problems with synthetic cytosine-rich NA fragments: Characterization of a thermostable conformer that oligo(dC) forms at neutral pH, and its role in the formation of cytosine i-quadruplex. The anomalous conformation of d(CnGn) oligonucleotides.Duplex,G-quadruplex and i-quadruplex formation in the d(CnGn) and d(GnCn) fragments of DNA, their competition and intramolecular coexistence. Bimolecular duplex-foldback equilibria in the (G+C) - rich oligonucleotides. Unusual conformations of the regulerly alternating d(IC)n, d(TC)n and d(AC)n motifs. Role of alkyl, alkenyl and alkynyl substituents in position 5 of cytosine in the conformational properties of the oligonucleotides. Comparison of crystal and solution conformations of G+C)-rich DNA fragments.These studies will help to understand the role of cytosine clustering, protonation, methylation and regular alternation in the conformational polymorphism of cytosine-rich genomic regions. Pomocí CD spektroskopie, PAGE a dalších metod budou řešeny následující problémy:I)Charakterizace termostabilního konformeru, který tvoří oligo(dC) při neutrálním pH, jeho úloha při tvorbě interkalovaného cytosinového kvadruplexu. II) Anomální konformace oligonukleotidů d(CnGn).III) Tvorba duplexu, quaninového a cytosinového kvadruplexu u d(CnGn) a d(GnCn), jejich kompetice a intramolekulární koexistence. IV) Konformační rovnováhy bimolekulárního duplexu a monomolekulárního vlásenkového uspořádání u oligonukleotidů bohatých na (G+C). V)Neobvyklé konformace motivů d(IC)n, d(TC)n a d(AC)n. VI) Ovlivnění konformačních vlastností oligonukleotidů alkylovými, alkenylovými a alkynylovými substituenty v poloze 5 cytosinu. VII) Srovnání konformací fragmentů DNA bohatých na (G+C) v krystalech roztoku. Výsledky pomohou pochopit úlohu shlukování cytosinů, jejich protonizace, metylace a pravidelného střídání s jinými bázemi v konformační polymorfii oblastí genomů bohatých na cytosin.

dcterms:title

Úloha cytosinu v konformační polymorfii DNA Role of cytosine in the conformational polymorphism of DNA

n3:dalsi-vedlejsi-obor

n4:EB

n3:druh-souteze

n6:

n3:faze

n8:19976160

n3:hlavni-obor

n4:BO

n3:vedlejsi-obor

n4:CE

n3:id-aktivity

n9:IA

n3:id-souteze

n10:

n3:kategorie

n12:0

n3:pocet-koordinujicich-prijemcu

0

n3:poskytovatel

n11:AV0

n3:statni-podpora

1425

n3:typProjektu

n7:P

n3:uznane-naklady

3750

n3:pocet-prijemcu

1

n3:pocet-spoluprijemcu

0

n3:pocet-vysledku

3

n3:pocet-vysledku-zverejnovanych

3