This HTML5 document contains 23 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/projekt/AV0/

Statements

Subject Item
n2:IAA1048103
rdf:type
n4:Projekt
dcterms:description
Projekt je zaměřen na teoretické simulace účinků ionizujícího záření (IZ) na komplexy DNA s proteiny. Dříve vyvinutý model pro simulace účinku OH radikálů vzniklých radiolýzou prostředí obklopujícího studovanou biomolekulu je založen na metodě Monte Carlo (simulace vzniku a difúze radikálů) a teorii Smoluchowského (chemické reakce OH radikálů s proteiny, zahrnutí vlivu ostatních produktů radiolýzy také simulace přímého účinku IZ (excitace a ionizace atomů DNA a proteinů). Výběr studovaných komplexů DNA-protein je ovlivněn dosažitelností jejich atomárních struktur v databankách (PDB, NDB) nebo molekulárním modelováním (program SYBYL) a případně též experimentálně měřených výtěžků radiačně indukovaných poškození. Pravděpodobnosti reakcí radikálů s DNA a proteiny budou analyzovány s ohledem na strukturu komplexů a charakteristiky IZ s cílem určit výtěžky a závažnost biologických poškození. The project includes theoretical simulation of radiation attack to DNA-protein complexes. Our model allows predicting the effectsof OH radicals produced by radiation in molecules` surroundings. The model is based on Monte Carlo simulation method (origin and radical diffusion) and Smoluchowski theory (radical reactions with DNA). We propose its extension for modelling radical reactions with proteins, the introduction of other radiolytic species and of the direct effect of radiation (ionizations and excitations of DNA and protein). The choice of DNA-protein complexes depends on:i) the availability of their molecular structures in databanks (PDB, NDB), ii) building by molecular modelling (software SYBYL) and iii) the availability of experimental yields of radiation-induced damages. Probabilities of radical reactions with DNA and proteins will be analyzed in terms of molecular structure and radiation parameters with the aim to obtain yields of some types of primary biological damages.
dcterms:title
Radiačně indukovaná poškození komplexů DNA s proteiny Radiation induced damage of DNA - protein complexes
n4:dalsi-vedlejsi-obor
n5:EB
n4:druh-souteze
n7:VS
n4:faze
n8:20856257
n4:hlavni-obor
n5:BO
n4:vedlejsi-obor
n5:CF
n4:id-aktivity
n11:IA
n4:id-souteze
n10:SAV0-AB2001
n4:kategorie
n12:0
n4:klicova-slova
Radiation domage; radiolytic attack; DNA-protein complex; molecular structure; theoretical modeling;
n4:pocet-koordinujicich-prijemcu
0
n4:poskytovatel
n9:AV0
n4:statni-podpora
738
n4:typProjektu
n6:P
n4:uznane-naklady
1543
n4:pocet-prijemcu
1
n4:pocet-spoluprijemcu
0
n4:pocet-vysledku
9
n4:pocet-vysledku-zverejnovanych
9