Po perorálním podání dochází k rychlé absorbci karbocysteinu. Vrcholových plasmatických koncentrací je dosaženo během jedné hodiny, vrcholových koncentrací v plicní tkáni dosahuje karbocystein během 3-4 hodin po perorální aplikaci. Biologický poločas je přibližně šest hodin.
Karbocystein se dobře distribuuje v tkáních celého těla. V mozkové tkáni je karbocystein však prakticky nedetekovatelný, zatímco plicní tkáň vykazuje vysokou afinitu pro karbocystein. Koncentrace karbocysteinu zjištěné v plicní tkáni převyšují koncentrace zjištěné v jiných tkáních a navíc jeho koncentrace v plicní tkáni klesá pomaleji něž v ostatních.
Po perorálním podání je karbocystein metabolizován acetylací, dekarboxylací a sulfoxidací. Karbocystein a jeho metabolity jsou téměř výlučně vylučovány ledvinami, pouze malé množství je vyloučeno stolicí. V nezměněné podobě je vyloučena hlavní část karbocysteinu, jeho metabolity tvoří menší podíl.
(cs)