About: Improved identification of von Hippel-Lindau gene alterations in clear cell renal tumors     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Cíl: poskytnout úplnou a důkladnou analýzu somatických mutací a promotorové hypermethylace VHL genu v nádorovém genomu, jedinečném pro světlobuněčný karcinom z ledvinných buněk. Identifikovat vztahy mezi prevalencí alteracemi VHL genu a subtypy alterací s charakteristikami pacientů a nádorů. Studie je navržena jako část velké studie případů a kontrol karcinomu ledvin provedené ve střední Evropě. Během ní byly analyzovány VHL mutace a methylace promotorů u 205 dobře charakterizovaných , histologicky potvrzených biopsií světlobuněčných karcinomů z ledvinných buněk (ccRCC) za použití vysoce senzitivních a výkonných metod (skenování endonukleáz a Sangerova sekvenování) a analýzy 11 CpG míst ve VHL promotoru. Výsledky: byly identifikovány mutace u 82,4% případů, nejvyšší dodnes udávaná prevalence. Analýza 11 promotorových CpG míst odhalila, že 8,3% nádorů bylo hypermethylováno a všechny byly mutace-negativní. Dohromady, 91% ccRCC vykazovalo alterace v genu, způsobené ať již genetickým nebo epigenetickým (cs)
  • PURPOSE: To provide a comprehensive, thorough analysis of somatic mutation and promoter hypermethylation of the von Hippel-Lindau (VHL) gene in the cancer genome, unique to clear cell renal cancer (ccRCC). Identify relationships between the prevalence of VHL gene alterations and alteration subtypes with patient and tumor characteristics. EXPERIMENTAL DESIGN: As part of a large kidney cancer case-control study conducted in Central Europe, we analyzed VHL mutations and promoter methylation in 205 well-characterized, histologically confirmed patient tumor biopsies using a combination of sensitive, high-throughput methods (endonuclease scanning and Sanger sequencing) and analysis of 11 CpG sites in the VHL promoter. RESULTS: We identified mutations in 82.4% of cases, the highest VHL gene mutation prevalence reported to date. Analysis of 11 VHL promoter CpG sites revealed that 8.3% of tumors were hypermethylated and all were mutation negative. In total, 91% of ccRCCs exhibited alteration of the gene throug
  • PURPOSE: To provide a comprehensive, thorough analysis of somatic mutation and promoter hypermethylation of the von Hippel-Lindau (VHL) gene in the cancer genome, unique to clear cell renal cancer (ccRCC). Identify relationships between the prevalence of VHL gene alterations and alteration subtypes with patient and tumor characteristics. EXPERIMENTAL DESIGN: As part of a large kidney cancer case-control study conducted in Central Europe, we analyzed VHL mutations and promoter methylation in 205 well-characterized, histologically confirmed patient tumor biopsies using a combination of sensitive, high-throughput methods (endonuclease scanning and Sanger sequencing) and analysis of 11 CpG sites in the VHL promoter. RESULTS: We identified mutations in 82.4% of cases, the highest VHL gene mutation prevalence reported to date. Analysis of 11 VHL promoter CpG sites revealed that 8.3% of tumors were hypermethylated and all were mutation negative. In total, 91% of ccRCCs exhibited alteration of the gene throug (en)
Title
  • Improved identification of von Hippel-Lindau gene alterations in clear cell renal tumors
  • Vylepšená identifikace alterací vhl genu u světlobuněčného karcinomu z ledvinných buněk (cs)
  • Improved identification of von Hippel-Lindau gene alterations in clear cell renal tumors (en)
skos:prefLabel
  • Improved identification of von Hippel-Lindau gene alterations in clear cell renal tumors
  • Vylepšená identifikace alterací vhl genu u světlobuněčného karcinomu z ledvinných buněk (cs)
  • Improved identification of von Hippel-Lindau gene alterations in clear cell renal tumors (en)
skos:notation
  • RIV/61989592:15110/08:00006193!RIV09-MZ0-15110___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(NR9029), R
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 15
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 371693
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/61989592:15110/08:00006193
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • VHL; cell renal tumors; mutation; promoter hypermethylation; case control study; Central Europe (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • US - Spojené státy americké
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [AADF7366F9A6]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Clinical Cancer Research
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 14
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Janout, Vladimír
  • Kollárová, Helena
  • Matveev, Vsevolod
  • Zaridze, David
  • Nickerson L, Michael
  • Durocher A, Jeffrey
  • Jäger, Erich
  • Mahurkar, Sunil
  • Shi, Yangu
issn
  • 1078-0432
number of pages
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 15110
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software