| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - The infrared (IR) and vibrational circular dichroism (VCD) spectra of guanosine-5´-hydrazide (G-1), a powerful hydrogelator, have been measured and analyzed on the basis of ab initio modeling. B3LYP/6-31G** DFT calculations predict that G-1, forming a clear solution in deuterated DMSO, is present in monomeric form in this solvent, whereas strong gelation in a phosphate buffer is due to the formation of a guanine(G)-quartet structure, (G-1)4, in which the four G-1 are linked by hydrogen-bonded guanine moieties and stabilized by an alkali metal cation. The B3LYP/6-31G** IR and VCD spectra of the nearly planar G-quartet whose structure is slightly distorted from the C4h symmetry, in which the G-bases interact via four Hoogsteen-type hydrogen bonds and a sodium cation is positioned in the middle of the G-quartet, are in very good agreement with the experimental spectra, indicating that this structure is the predominant structure in the gel state. The geometric parameters are discussed. This study is the f
- The infrared (IR) and vibrational circular dichroism (VCD) spectra of guanosine-5´-hydrazide (G-1), a powerful hydrogelator, have been measured and analyzed on the basis of ab initio modeling. B3LYP/6-31G** DFT calculations predict that G-1, forming a clear solution in deuterated DMSO, is present in monomeric form in this solvent, whereas strong gelation in a phosphate buffer is due to the formation of a guanine(G)-quartet structure, (G-1)4, in which the four G-1 are linked by hydrogen-bonded guanine moieties and stabilized by an alkali metal cation. The B3LYP/6-31G** IR and VCD spectra of the nearly planar G-quartet whose structure is slightly distorted from the C4h symmetry, in which the G-bases interact via four Hoogsteen-type hydrogen bonds and a sodium cation is positioned in the middle of the G-quartet, are in very good agreement with the experimental spectra, indicating that this structure is the predominant structure in the gel state. The geometric parameters are discussed. This study is the f (en)
- Infračervená (IČ) spektra a spektra vibračního cirkulárního dichroismu (VCD) účinného hydrogelátoru, guanosin-5´-hydrazidu (G-1), byla měřena a analyzována na základě ab initio modelování. B3LYP/6-31G** DFT výpočty predikují, že G-1 tvořící čirý roztok v deuterovaném DMSO je přítomen v monomerní formě v tomto rozpouštědle, zatímco silné gelovatění ve fosfátovém pufru je zapříčiněno vznikem guaninových(G)-kvartetů, (G-1)4, ve kterých jsou čtyři G-1 molekuly spojeny vodíkovými vazbami mezi guaniny a jsou stabilizovány kationtem alkalického kovu. V nejlepším souladu s experimentálními spektry byla IČ a VCD spektra získaná B3LYP/6-31G** metodou pro takřka planární G-kvartet, jehož struktura je jen mírně vychýlena z C4h symetrie a ve které G-báze interagují prostřednictvím čtyř vodíkových vazeb Hoogsteenovského typu a sodný kation je umístěn uprostřed G-kvartetu. Tato struktura se ukázala být dominantní strukturou ve fázi gelu a její geometrické parametry jsou diskutovány. Tato studie je první, která využ (cs)
|
| Title
| - Molecular Structure of Guanine-Quartet Supramolecular Assemblies in a Gel-State Based on a DFT Calculation of Infrared and Vibrational Circular Dichroism Spectra
- Molecular Structure of Guanine-Quartet Supramolecular Assemblies in a Gel-State Based on a DFT Calculation of Infrared and Vibrational Circular Dichroism Spectra (en)
- Molekulární struktura supramolekulárních samoskladných systémů obsahujících guaninový kvartet založená na DFT výpočtech infračervených spekter a spekter vibračního cirkulárního dichroismu (cs)
|
| skos:prefLabel
| - Molecular Structure of Guanine-Quartet Supramolecular Assemblies in a Gel-State Based on a DFT Calculation of Infrared and Vibrational Circular Dichroism Spectra
- Molecular Structure of Guanine-Quartet Supramolecular Assemblies in a Gel-State Based on a DFT Calculation of Infrared and Vibrational Circular Dichroism Spectra (en)
- Molekulární struktura supramolekulárních samoskladných systémů obsahujících guaninový kvartet založená na DFT výpočtech infračervených spekter a spekter vibračního cirkulárního dichroismu (cs)
|
| skos:notation
| - RIV/60461373:22340/08:00020689!RIV09-MSM-22340___
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| - Z(MSM6046137301), Z(MSM6046137307)
|
| http://linked.open...iv/cisloPeriodika
| |
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/60461373:22340/08:00020689
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - gelator; supramolecular chemistry; guanine quartet; vibrational circular dichroism; density functional calculations (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...odStatuVydavatele
| - US - Spojené státy americké
|
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| |
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...v/svazekPeriodika
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Böhm, Stanislav
- Urbanová, Marie
- Setnička, Vladimír
- Volka, Karel
- Nový, Jakub
- Sreenivasachary, Nampally
|
| http://linked.open...ain/vavai/riv/wos
| |
| http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
| |
| issn
| |
| number of pages
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
| is http://linked.open...avai/riv/vysledek
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)