About: Application of ambient mass spectrometry for evaluation of resistance of cereals against Fusarium micromycetes infestation     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Among the significant negative impacts on the production of cereals include operations of fungal genus Fusarium. The most widespread species causing fusarium graminearum fusaria are F., F. culmorum, F. avenaceum and F. poae. Fusarium incidence and the subsequent production of toxic secondary metabolites - mycotoxins - is influenced by many factors, including temperature conditions, and especially during the growth and the type of crop. Development infection can to some extent affect the selection of suitable varieties grown cereals and crop, applications pesticide formulations and storage conditions. Metabolomic profiling is a new approach that can be used to assess the degree of infestation micromycetes. The principle of this technique is the target / nontarget analysis sample of low-molecular substances (metabolome). If the measurement does not identify these compounds, in terms of metabolomic fingerprinting. The aim of this study is the application of fingerprinting metabolomického to sample the different varieties of wheat from many localities of the Czech Republic in order to create models based on which it would be possible to classify samples according to (i) detection of pathogen F. graminearum, (ii) deterioration of the grains, and (iii) detection of mycotoxin deoxynivalenol (DON). For this experiment was used direct analysis in real time (DART) with mass spectrometric detection with HRMS Orbitrap analyzer type. A significant advantage of this technique is very low analysis time allowing rapid detection results. Measured data was processed by a statistical analysis of principal components (PCA) which is used to reduce the original quantity of data in order to determine their structure in order to preserve as much information as possible, and consequently the linear discriminant analysis (LDA), which serves to produce the desired model for classification of samples analyzed . (en)
  • Mezi významné negativní vlivy v produkci obilovin patří působení mikromycet rodu Fusarium. Onemocnění způsobené těmito mikromycetami jsou obecně nazývány fusariózy. Nejrozšířenějšími druhy fusarií způsobujících fusariózy jsou F. graminearum, F. culmorum, F. avenaceum a F. poae. Výskyt fusarií a následná produkce jejich toxických sekundárních metabolitů - mykotoxinů - je ovlivněna celou řadou faktorů, mezi něž patří především a teplotní podmínky během růstu a typ předplodiny. Rozvoj infekce lze do jisté míry ovlivnit výběrem vhodné odrůdy pěstované obiloviny a předplodiny, aplikací pesticidních přípravků a skladovacími podmínkami. Metabolomické profilování je novým přístupem, který lze využít pro posouzení míry napadení mikromycetami. Principem této techniky je cílová/necílová analýza nízkomolekulárních látek vzorku (metabolomu). Pokud při měření nedochází k identifikaci těchto látek, jde o metabolomický fingerprinting. Pro analýzu metabolomického profilu/fingerprintu se často využívá kombinací chromatografických a hmotnostně-spektrometrických technik. Cílem této studie je aplikace metabolomického fingerprintingu na soubor vzorků různých odrůd pšenice pocházejících z mnoha lokalit ČR za účelem vytvoření modelů, na základě kterých by bylo možné klasifikovat vzorky dle (i) detekce pathogenu F. graminearum, (ii) poškození zrn a (iii) detekce mykotoxinu deoxynivalenolu (DON). Pro tento experiment byla využita přímá analýza v reálném čase (DART) s hmotnostně-spektrometrickou detekcí s vysokorozlišovacím analyzátorem typu orbitrap. Značnou předností této techniky je velmi nízký čas analýzy umožňující rychlé zjištění výsledků. Naměřená data byla zpracována statistickou analýzou hlavních komponent (PCA), která slouží k redukci původního množství dat za účelem zjištění jejich struktury s cílem zachování co největšího množství informací a následně lineární diskriminační analýzou (LDA), která slouží k vytvoření požadovaných modelů pro klasifikaci analyzovaných vzorků.
  • Mezi významné negativní vlivy v produkci obilovin patří působení mikromycet rodu Fusarium. Onemocnění způsobené těmito mikromycetami jsou obecně nazývány fusariózy. Nejrozšířenějšími druhy fusarií způsobujících fusariózy jsou F. graminearum, F. culmorum, F. avenaceum a F. poae. Výskyt fusarií a následná produkce jejich toxických sekundárních metabolitů - mykotoxinů - je ovlivněna celou řadou faktorů, mezi něž patří především a teplotní podmínky během růstu a typ předplodiny. Rozvoj infekce lze do jisté míry ovlivnit výběrem vhodné odrůdy pěstované obiloviny a předplodiny, aplikací pesticidních přípravků a skladovacími podmínkami. Metabolomické profilování je novým přístupem, který lze využít pro posouzení míry napadení mikromycetami. Principem této techniky je cílová/necílová analýza nízkomolekulárních látek vzorku (metabolomu). Pokud při měření nedochází k identifikaci těchto látek, jde o metabolomický fingerprinting. Pro analýzu metabolomického profilu/fingerprintu se často využívá kombinací chromatografických a hmotnostně-spektrometrických technik. Cílem této studie je aplikace metabolomického fingerprintingu na soubor vzorků různých odrůd pšenice pocházejících z mnoha lokalit ČR za účelem vytvoření modelů, na základě kterých by bylo možné klasifikovat vzorky dle (i) detekce pathogenu F. graminearum, (ii) poškození zrn a (iii) detekce mykotoxinu deoxynivalenolu (DON). Pro tento experiment byla využita přímá analýza v reálném čase (DART) s hmotnostně-spektrometrickou detekcí s vysokorozlišovacím analyzátorem typu orbitrap. Značnou předností této techniky je velmi nízký čas analýzy umožňující rychlé zjištění výsledků. Naměřená data byla zpracována statistickou analýzou hlavních komponent (PCA), která slouží k redukci původního množství dat za účelem zjištění jejich struktury s cílem zachování co největšího množství informací a následně lineární diskriminační analýzou (LDA), která slouží k vytvoření požadovaných modelů pro klasifikaci analyzovaných vzorků. (cs)
Title
  • Application of ambient mass spectrometry for evaluation of resistance of cereals against Fusarium micromycetes infestation (en)
  • Aplikace hmotnostní spektrometrie v otevřeném prostoru pro hodnocení rezistence cereálií vůči napadení mikromycetami r. Fusarium
  • Aplikace hmotnostní spektrometrie v otevřeném prostoru pro hodnocení rezistence cereálií vůči napadení mikromycetami r. Fusarium (cs)
skos:prefLabel
  • Application of ambient mass spectrometry for evaluation of resistance of cereals against Fusarium micromycetes infestation (en)
  • Aplikace hmotnostní spektrometrie v otevřeném prostoru pro hodnocení rezistence cereálií vůči napadení mikromycetami r. Fusarium
  • Aplikace hmotnostní spektrometrie v otevřeném prostoru pro hodnocení rezistence cereálií vůči napadení mikromycetami r. Fusarium (cs)
skos:notation
  • RIV/60461373:22330/14:43898090!RIV15-MZE-22330___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(QI111B044)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 3575
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/60461373:22330/14:43898090
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • DART-HRMS; Fusarium; mycotoxins; Cereals (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [8ACC14EC11BD]
http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
  • Skalský Dvůr
http://linked.open...i/riv/mistoVydani
  • Praha
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • XLIV. Symposium o nových směrech výroby a hodnocení potravin
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Hajšlová, Jana
  • Zachariášová, Milena
  • Džuman, Zbyněk
  • Vepříková, Zdenka
  • Slavíková, Petra
  • Jírů, Monika
http://linked.open...vavai/riv/typAkce
http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
issn
  • 1802-1433
number of pages
http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
  • Výzkumný ústav potravinářský Praha, v.v.i.
https://schema.org/isbn
  • 978-80-86909-09-7
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 22330
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software