| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Geographic localization, climate and factors of populations have influence on genetic diversity and epidemiology of VZV infections. Studies of genetic diversity of VZV, in turn, play an important role in further understandig of epidemiology and evolution of the virus, and may in future serve as a tool for genetic prediction of virus pathogenicity or resistence development. We tested the group of 153 clinical specimens. All of them were collected in Czech Republic from 2005 to 2009. The differenciation of wild-type and vaccine VZV strains was detected using markers in ORF 38, 54 and 62. Single nucleotide polymorphisms in ORF 21, 22 and 50 detected and characterized individual wild type strains. One specimen from 153 total was negative, 95 cases were varicella, 57 cases were zoster. 71 cases (47 %) were E1 wild-type VZV strains, 81 cases (53 %) were detected as E2 VZV strain. No one was VZV vaccinated. (en)
- V naší studii jsme podrobili molekulárně genetické analýze soubor 153 klinických vzorků, pocházejících výhradně z České republiky. Sběr byl uskutečněn mezi roky 2005-2009. Metoda real-time PCR detekující markery v oblastech ORF 38, 54 a 62 umožnila rozlišení mezi divokými a vakcinačními kmeny VZV. Typizace jednotlivých divokých kmenů pak byla vyšetřena pomocí sekvenační analýzy fragmentů deoxyribonukleové kyseliny (DNA) z oblasti ORF 21, 22 a 50, se zaměřením na zachycení změn v jednotlivých nukleotidových bázích, tzv. single nucleotide polymorphism (SNP). Z celkového počtu 153 vyšetřených klinických vzorků bylo 95 případů určeno jako varicella a 57 případů jako zoster. Jeden vzorek byl VZV negativní. Všech 152 pozitivních případů patřilo mezi divoké kmeny VZV, z toho 71 (tj. 47 %) bylo vyhodnoceno jako E1 kmen a 81 (tj. 53 %) bylo typizováno jako E2 kmen. Do vyšetřované skupiny pacientů nebyli zahrnuti ti, kteří v dotazníku udali pozitivní informaci o očkování proti VZV.
- V naší studii jsme podrobili molekulárně genetické analýze soubor 153 klinických vzorků, pocházejících výhradně z České republiky. Sběr byl uskutečněn mezi roky 2005-2009. Metoda real-time PCR detekující markery v oblastech ORF 38, 54 a 62 umožnila rozlišení mezi divokými a vakcinačními kmeny VZV. Typizace jednotlivých divokých kmenů pak byla vyšetřena pomocí sekvenační analýzy fragmentů deoxyribonukleové kyseliny (DNA) z oblasti ORF 21, 22 a 50, se zaměřením na zachycení změn v jednotlivých nukleotidových bázích, tzv. single nucleotide polymorphism (SNP). Z celkového počtu 153 vyšetřených klinických vzorků bylo 95 případů určeno jako varicella a 57 případů jako zoster. Jeden vzorek byl VZV negativní. Všech 152 pozitivních případů patřilo mezi divoké kmeny VZV, z toho 71 (tj. 47 %) bylo vyhodnoceno jako E1 kmen a 81 (tj. 53 %) bylo typizováno jako E2 kmen. Do vyšetřované skupiny pacientů nebyli zahrnuti ti, kteří v dotazníku udali pozitivní informaci o očkování proti VZV. (cs)
|
| Title
| - Využití sekvenční analýzy divokých kmenů viru planých neštovic se zaměřením na epidemiologickou situaci v České republice
- Sequencing analysis of wild type VZV (en)
- Využití sekvenční analýzy divokých kmenů viru planých neštovic se zaměřením na epidemiologickou situaci v České republice (cs)
|
| skos:prefLabel
| - Využití sekvenční analýzy divokých kmenů viru planých neštovic se zaměřením na epidemiologickou situaci v České republice
- Sequencing analysis of wild type VZV (en)
- Využití sekvenční analýzy divokých kmenů viru planých neštovic se zaměřením na epidemiologickou situaci v České republice (cs)
|
| skos:notation
| - RIV/60162694:G44__/10:00002229!RIV11-GA0-G44_____
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
| http://linked.open...iv/cisloPeriodika
| |
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/60162694:G44__/10:00002229
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - varicella-yoster virus; genotzping; divoké kmeny; ORF 21, 22, 50 (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...odStatuVydavatele
| |
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| |
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...v/svazekPeriodika
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Boštík, Pavel
- Boštíková, Vanda
- Chlíbek, Roman
- Plíšek, Stanislav
- Smetana, Jan
- Špliňo, Miroslav
- Hanovcová, Irena
- Vacková, Marie
- Salavec, M.
- Štěpánová, Vlasta
|
| issn
| |
| number of pages
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
| is http://linked.open...avai/riv/vysledek
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)