About: Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	Subtelomeric regions reveal a relatively high degree of polymorphism due to the increased frequency of recombination events in these chromosome loci. In a search for molecular markers applicable to genotyping of potato varieties, we focused on two possible sources of polymorphism occurring in this region: (i) arrangement of blocks of subtelomeric chromatin; (ii) structure of telomere-subtelomere boundary. Further, the telomere-subtelomere boundary sequences were amplified using telomeric and ST3-specific primers and the obtained products were cloned. Sequence analysis of the clones resulted in characterisation of a novel telomere-associated sequence (FIN2). The described combinations of sequence-specific primers may be used for the fast, cheap and reproducible PCR-genotyping of selected potato varieties. (en) Subtelomerické oblasti se vyznačují relativně vysokým stupněm polymorfismu vzhledem ke zvýšené frekvenci rekombinací v těchto chromozomálních lokusech. Při hledání molekulárních markerů použitelných pro genotypizaci odrůd bramboru se autoři zaměřili na dva možné zdroje polymorfismů vyskytující se v této oblasti: 1. uspořádání bloků subtelomerového chromatinu; 2. struktura rozhraní telomera-subtelomera. S použitím telomerového primeru v kombinaci s některým ze ST3- specifických primerů byly dále amplifikovány a následně klonovány hraniční úseky mezi telomerou a subtelomerou. Výsledkem sekvenční analýzy získaných klonů byla charakterizace nové telomer-asociované sekvence (FIN2). Popsané kombinace sekvenčně-specifických primerů mohou být použity pro rychlou, levnou a reprodukovatelnou genotypizaci vybraných odrůd bramboru. Subtelomerické oblasti se vyznačují relativně vysokým stupněm polymorfismu vzhledem ke zvýšené frekvenci rekombinací v těchto chromozomálních lokusech. Při hledání molekulárních markerů použitelných pro genotypizaci odrůd bramboru se autoři zaměřili na dva možné zdroje polymorfismů vyskytující se v této oblasti: 1. uspořádání bloků subtelomerového chromatinu; 2. struktura rozhraní telomera-subtelomera. S použitím telomerového primeru v kombinaci s některým ze ST3- specifických primerů byly dále amplifikovány a následně klonovány hraniční úseky mezi telomerou a subtelomerou. Výsledkem sekvenční analýzy získaných klonů byla charakterizace nové telomer-asociované sekvence (FIN2). Popsané kombinace sekvenčně-specifických primerů mohou být použity pro rychlou, levnou a reprodukovatelnou genotypizaci vybraných odrůd bramboru. (cs)
Title	Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru (cs) Structural variability of subtelomeres applied for genotyping of selected potato varieties (en)
skos:prefLabel	Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru (cs) Structural variability of subtelomeres applied for genotyping of selected potato varieties (en)
skos:notation	RIV/60109807:_____/05:#0000004!RIV06-MSM-60109807
http://linked.open.../vavai/riv/strany	17-22
http://linked.open...avai/riv/aktivita	Z
http://linked.open...avai/riv/aktivity	Z(MSM6010980701)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika	1
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2006
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Ptáček, Jiří
http://linked.open.../riv/druhVysledku	J - Článek v odborném periodiku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, s.r.o.
http://linked.open...dnocenehoVysledku	545034
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/60109807:_____/05:#0000004
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	genotypizace, brambor, PCR, subtelomera, telomer-asociované DNA sekvence (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	PCR genotypizace subtelomera telomer-asociované DNA sekvence brambor
http://linked.open...odStatuVydavatele	CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[14A26BA91040]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Czech Journal of Genetics and Plant Breeding
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	GE
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	5 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	5 (xsd:int)
http://linked.open...UplatneniVysledku	2005
http://linked.open...v/svazekPeriodika	41
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Ptáček, Jiří
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer	Molekulární a technologické základy produkce kvalitních brambor
issn	1212-1975
number of pages	6 (xsd:int)
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of	Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software