About: Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • A collection of 22 cloned trypanosome isolates from 14 species of European freshwater fish and 1 species of African freshwater fish were examined by phylogenetic analysis. SSU rRNA genes of 8 isolates were sequenced and compared with sequences from a wide selection of vertebrate trypanosome isolates. All freshwater isolates fell in a single clade, subdivided into 3 groups. This clade sits within a robust clade of trypanosomes from marine fish, amphibia, reptiles and the duck-billed platypus. All 22 trypanosome clones were analysed by RAPD. The resulting tree shows 3 groups congruent with the groups identified in the ssu rRNA gene phylogeny. Two of these groups contain the majority of isolates. These groups do not separate trypanosome species distinguished by morphology or host origin, and thus these criteria do not appear to be reliable guides to genetic relationships among fish trypanosomes. The two groups themselves may represent different species of fish trypanosomes.
  • A collection of 22 cloned trypanosome isolates from 14 species of European freshwater fish and 1 species of African freshwater fish were examined by phylogenetic analysis. SSU rRNA genes of 8 isolates were sequenced and compared with sequences from a wide selection of vertebrate trypanosome isolates. All freshwater isolates fell in a single clade, subdivided into 3 groups. This clade sits within a robust clade of trypanosomes from marine fish, amphibia, reptiles and the duck-billed platypus. All 22 trypanosome clones were analysed by RAPD. The resulting tree shows 3 groups congruent with the groups identified in the ssu rRNA gene phylogeny. Two of these groups contain the majority of isolates. These groups do not separate trypanosome species distinguished by morphology or host origin, and thus these criteria do not appear to be reliable guides to genetic relationships among fish trypanosomes. The two groups themselves may represent different species of fish trypanosomes. (en)
  • Molekulárně fylogenetickými metodami bylo analyzováno 22 klonů trypanosom izolovaných ze 14 druhů sladkovodních ryb. SSU rRNA geny 8 klonů byly sekvenovány a porovnány se sekvencemi ssu rRNA genů trypanosom širšího souboru obratlovců. Všechny trypanosomy ze sladkovodních ryb spadly do jednoho kladu rozděleného na 3 skupiny. Tento klad je součástí většího robustního kladu obsahujícího trypanosomy mořských ryb a různých obojživelníků. Všech 22 klonů trypanosom bylo analyzováno metodou RAPD. Výsledný dendrogram ukazuje 3 skupiny, které jsou shodné se skupinami identifikovanými ve fylogenezi ssu rRNA genu. Dvě skupiny obsahují většinu izolátů trypanosom, rozdíly uvnitř skupin jsou jen malé. Tyto skupiny neoddělují druhy trypanosom rozlišené podle morfologie nebo původu hostitele. Použitá kritéria tedy nejsou spolehlivými vodítky pro zjišťování genetické příbuznosti rybích trypanosom. Výsledky práce naznačují, že 2 skupiny samy o sobě mohou představovat rozdílné druhy trypanosom ryb. (cs)
Title
  • Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA
  • Fylogenetická analýza trypanosom sladkovodních ryb Evropy využívající sekvence ssu rRNA genu a polymorfismus náhodně amplifikované DNA (cs)
  • Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA (en)
skos:prefLabel
  • Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA
  • Fylogenetická analýza trypanosom sladkovodních ryb Evropy využívající sekvence ssu rRNA genu a polymorfismus náhodně amplifikované DNA (cs)
  • Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA (en)
skos:notation
  • RIV/60077409:_____/05:00025690!RIV06-AV0-60077409
http://linked.open.../vavai/riv/strany
  • 405;412
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • Z(AV0Z60220518)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 4
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 535975
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/60077409:_____/05:00025690
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • trypanosomes; freshwater fish; phylogeny (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [945AD8ACBB60]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Parasitology
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 130
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Pecková, Hana
  • Lom, Jiří
  • Ferris, V. R.
  • Gibson, W. C.
  • Hamilton, P. B.
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
issn
  • 0031-1820
number of pages
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of
Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 80 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software