Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
Description
| - Application of molecular phylogenetics in the traditional fashion may, in many cases, be insufficient or even improper for solving evolutionary problems. These limitations are due to such factors as a scarcity/ambiguity of phylogenetic information in the sequences, an intricacy of gene relationships at low phylogenetic levels, or a lack of criteria when deciding among several competing coevolutionary scenarios. In this review, novel approaches potentially applicable to parasitological research are presented and their advantages as well as drawbacks are discussed. These issues include the usage of idiosyncratic markers (unique features with presumably low probability of homoplasy), such as insertion of mobile elements, gene rearrangements and secondary structure features; the problem of ancestral polymorphism and reticulate relationships at low phylogenetic levels; and the utility of a molecular clock to facilitate discrimination among alternative scenarios in host–parasite coevolution.
- Application of molecular phylogenetics in the traditional fashion may, in many cases, be insufficient or even improper for solving evolutionary problems. These limitations are due to such factors as a scarcity/ambiguity of phylogenetic information in the sequences, an intricacy of gene relationships at low phylogenetic levels, or a lack of criteria when deciding among several competing coevolutionary scenarios. In this review, novel approaches potentially applicable to parasitological research are presented and their advantages as well as drawbacks are discussed. These issues include the usage of idiosyncratic markers (unique features with presumably low probability of homoplasy), such as insertion of mobile elements, gene rearrangements and secondary structure features; the problem of ancestral polymorphism and reticulate relationships at low phylogenetic levels; and the utility of a molecular clock to facilitate discrimination among alternative scenarios in host–parasite coevolution. (en)
- Použití metod molekulární fylogenetiky v její tradiční podobě může být při řešení některých evolučních otázek nedostatečné nebo přímo zavádějící. Toto omezení vyplývá z různých faktů, jako je například nedostatek či neprůkaznost fylogenetické informace v sekvencích DNA, složitost vztahů mezi geny na nízké fylogenetické úrovni, nebo absence kritérií pro volbu mezi alternativními koevolučními hypotézami. Prezentované review přináší přehled nových přístupů potenciálně využitelných v parazitologickém výzkumu a diskutuje jejich výhody i nedostatky. Tyto přístupy zahrnují 1) využití „idiosynkratických“ znaků (jedinečných znaků s nízkou úrovní homoplazií), jako jsou například mobilní elementy, genové uspořádání a prvky sekundární struktury DNA, 2) řešení ancestrálního polymorfismu a retikulárních vztahů na nízké fylogenetické úrovni, 3) využití molekulárních hodin při volbě mezi alternativními hypotézami o koevoluci parazita a hostitele. (cs)
|
Title
| - Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers
- Historie parazitů a nové fylogenetické metody: alternativní přístupy k rekonstrukci evoluce parazitů z molekulárních dat (cs)
- Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers (en)
|
skos:prefLabel
| - Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers
- Historie parazitů a nové fylogenetické metody: alternativní přístupy k rekonstrukci evoluce parazitů z molekulárních dat (cs)
- Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers (en)
|
skos:notation
| - RIV/60077344:_____/06:00051237!RIV07-AV0-60077344
|
http://linked.open.../vavai/riv/strany
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivity
| - P(GA206/04/0520), Z(AV0Z60220518)
|
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
| |
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
http://linked.open...titaPredkladatele
| |
http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/60077344:_____/06:00051237
|
http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - molecular phylogeny; parasite evolution (en)
|
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
http://linked.open...odStatuVydavatele
| - AU - Australské společenství
|
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| - International Journal for Parasitology
|
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
http://linked.open...v/svazekPeriodika
| |
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| |
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
| |
issn
| |
number of pages
| |
is http://linked.open...avai/riv/vysledek
of | |