About: Metodika vyhledávání dárce dle DNA faktorů     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Jedná se o metodiku vyhledávání potenciálně shodných dárců kostní dřeně, která je založena na využití pravděpodobnostních modelů haplotypů nepříbuzných jedinců s nejednoznačnou typizací a pravděpodobnostních modelů shod pacient-dárce. Vstupem pro vyhledávání je aktuální seznam všech známých haplotypů a provedené typizace dárců. Metodika popisuje jednotlivé kroky potřebné pro vyhledání potenciálně shodných dárců, konkrétně rozklad variant antigenů na jednotlivé možné varianty pro všechny lokusy v závislosti na rozlišení typizace (rozklad NMDP, MAC kódů, sérologická data apod.), metody sestavování kombinací všech možných haplotypů (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 a jejich podmnožin) nad možnými variantami a tvorbu všech možných genotypů pro každého dárce, EM algoritmus využívaný pro odhad pravděpodobností genotypů i haplotypů (identifikace pravděpodobnostních modelů) a realizaci samotného vyhledávání dle požadovaných kritérií včetně vizualizace výsledků vyhledávání.
  • Jedná se o metodiku vyhledávání potenciálně shodných dárců kostní dřeně, která je založena na využití pravděpodobnostních modelů haplotypů nepříbuzných jedinců s nejednoznačnou typizací a pravděpodobnostních modelů shod pacient-dárce. Vstupem pro vyhledávání je aktuální seznam všech známých haplotypů a provedené typizace dárců. Metodika popisuje jednotlivé kroky potřebné pro vyhledání potenciálně shodných dárců, konkrétně rozklad variant antigenů na jednotlivé možné varianty pro všechny lokusy v závislosti na rozlišení typizace (rozklad NMDP, MAC kódů, sérologická data apod.), metody sestavování kombinací všech možných haplotypů (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 a jejich podmnožin) nad možnými variantami a tvorbu všech možných genotypů pro každého dárce, EM algoritmus využívaný pro odhad pravděpodobností genotypů i haplotypů (identifikace pravděpodobnostních modelů) a realizaci samotného vyhledávání dle požadovaných kritérií včetně vizualizace výsledků vyhledávání. (cs)
  • It is a methodology for potential bone marrow donors matching , which is based on the use of probabilistic models of unrelated donors haplotypes with ambiguous typing and probabilistic models of patient-donor histocompatibility . The input to the search is a actual list of all worldwide known haplotypes and list of donors typing. The methodology describes the steps needed for finding potentially match donors, namely antigens decomposition on the various possible options for all loci , depending on the typing resolution (NMDP, MAC codes, serological data decomposition, etc. ), methods of assembling a combination of all possible haplotypes (HLA -A / B/C/DRB1/DQB1 and their subsets) using possible antigen/allele options and the formation of all possible genotypes for each donor, EM algorithm used to estimate the probability of genotypes and haplotypes (identification of probabilistic models) and implementation of the donor search according to the required criteria, including visualization of search results. (en)
Title
  • Metodika vyhledávání dárce dle DNA faktorů
  • Metodika vyhledávání dárce dle DNA faktorů (cs)
  • A Scalable Method for Efficient Stem Cell Donor HLA Genotype Match Determination (en)
skos:prefLabel
  • Metodika vyhledávání dárce dle DNA faktorů
  • Metodika vyhledávání dárce dle DNA faktorů (cs)
  • A Scalable Method for Efficient Stem Cell Donor HLA Genotype Match Determination (en)
skos:notation
  • 20140101 - STDC - Standards, Search Algorithm Subcommittee - http://login.wmda.info/index.php?id=qawg-sa-gen&type=1
  • RIV/49777513:23520/14:43920535!RIV15-TA0-23520___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(TA01010342)
http://linked.open...certifikacniOrgan
  • WMDA (World Marrow Donors Association), Plesmanlaan 1b, 6th floor 2333 BZ Leiden, The Netherlands
http://linked.open.../datumCertifikace
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...onomickeParametry
  • Metodika je plánovaným výstupem projektu TA01010342, jehož ekonomický přínos je definován jako relevantní podíl přínosů projektu. Výsledek umožní zvýšení objemu a zisku v aplikovaném výzkumu a zvýší přesnost a správnost údajů nutných při výběru vhodného dárce krvetvorných buněk, čímž dojde k urychlení a zpřesnění výběru dárců v rámci transplantačního procesu.
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 28913
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/49777513:23520/14:43920535
http://linked.open...terniIdentifikace
  • DNAvyhledavani
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • probabilistic models; typing; genotype; haplotype; bone marrow donors search (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [7767398EB0ED]
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...echnickeParametry
  • Výsledek je plánovaným výstupem TA ČR TA01010342 s počátkem řešení od 1.1.2011 - 31.12.2014. Kontaktní osoba ZČU: Daniel GEORGIEV, PhD., Západočeská univerzita v Plzni, Nové technologie pro informační společnost, Univerzitní 22, 306 14 Plzeň (georgiev@kky.zcu.cz). 2014-003
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Georgiev, Daniel
  • Houdová, Lucie
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 23520
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software