About: Optimal donor search using DNA typing data

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Optimal donor search using DNA typing data Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
rdfs:seeAlso	http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/vyhledavani_DNA
Description	Jedná se o prototypové řešení vyhledávání potenciálně shodných dárců kostní dřeně využivající pravděpodobnostní modely haplotypů a genotypů nepříbuzných jedinců a HLA shod pacient-dárce. Řešení zahrnuje implementaci potřebného rozkladu variant antigenů pro všechny lokusy (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1) v závislosti na rozlišení typizace (rozklad NMDP, MAC kódů), vypořádání se se sérologickými daty, identifikované pravděpodobnostní modely všech možných haplotypů a genotypů pomocí EM algoritmu, možnosti volby požadovaných kritérií (např. požadovanou HLA shodu 10/10, 9/10 HLA-A mismatch (neshoda) , 7/8 HLA-C mismatch) . Jedná se o prototypové řešení vyhledávání potenciálně shodných dárců kostní dřeně využivající pravděpodobnostní modely haplotypů a genotypů nepříbuzných jedinců a HLA shod pacient-dárce. Řešení zahrnuje implementaci potřebného rozkladu variant antigenů pro všechny lokusy (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1) v závislosti na rozlišení typizace (rozklad NMDP, MAC kódů), vypořádání se se sérologickými daty, identifikované pravděpodobnostní modely všech možných haplotypů a genotypů pomocí EM algoritmu, možnosti volby požadovaných kritérií (např. požadovanou HLA shodu 10/10, 9/10 HLA-A mismatch (neshoda) , 7/8 HLA-C mismatch) . (cs) This is a prototype solution for potentially match of unrelated stem cell donors utilizing probabilistic models of haplotypes and genotypes and patient-donor HLA match. Solutions include implementation of the required antigens decomposition for all loci (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1) depended on typing resolution (NMDP, MAC codes), dealing with the serological data, identified probability models of all possible haplotypes and genotypes (by EM algorithm) and search criteria options (e.g. 10/10 match, 9/10 HLA-A mismatch, 7/8 HLA-C mismatch). (en)
Title	Optimal donor search using DNA typing data (en) Výběr optimálního dárce s využitím dat DNA typizace Výběr optimálního dárce s využitím dat DNA typizace (cs)
skos:prefLabel	Optimal donor search using DNA typing data (en) Výběr optimálního dárce s využitím dat DNA typizace Výběr optimálního dárce s využitím dat DNA typizace (cs)
skos:notation	RIV/49777513:23520/13:43920563!RIV14-TA0-23520___
http://linked.open...avai/predkladatel	Fakulta aplikovaných věd
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(TA01010342)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2014
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Fetter, Miloš Georgiev, Daniel Houdová, Lucie
http://linked.open.../riv/druhVysledku	G/A - Prototyp
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...onomickeParametry	Prototyp je plánovaným výstupem projektu TA01010342, jehož ekonomický přínos je definován jako relevantní podíl přínosů projektu. Výsledek umožní zvýšení objemu a zisku v aplikovaném výzkumu, přesnější vyhledání vhodného dárce, a tím finanční úsporu a urychlení transplantačního procesu.
http://linked.open...titaPredkladatele	Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd
http://linked.open...dnocenehoVysledku	115190
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/49777513:23520/13:43920563
http://linked.open...terniIdentifikace	DNA prototyp
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open...vai/riv/kategorie	A - Do 5 mil. Kč
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	probabilistic models; genotype; haplotype; bone marrow donors search (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	haplotype probabilistic models genotype bone marrow donors search
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[612AFAF21634]
http://linked.open.../licencniPoplatek	A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	IN
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	3 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	3 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Research and development of advanced IT technologies for support of bone marrow donor searching for transplantation
http://linked.open...UplatneniVysledku	2013
http://linked.open...echnickeParametry	Eduard Janeček, Univerzitní 8, 301 00 Plzeň, email: janecek@kky.zcu.cz, tel. +420 377 632 506
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Georgiev, Daniel Houdová, Lucie Fetter, Miloš
http://linked.open...avai/riv/vlastnik	Západočeská univerzita v Plzni
http://linked.open...itiJinymSubjektem	A - Nabytí licence je nutné vždy
http://localhost/t...ganizacniJednotka	23520

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software